Пакет: ggd-utils (1.0.0+ds-1 и другие)

[ Источник: ggd-utils  ]

programs for use in ggd

Takes a genome file and (currently) a .vcf.gz or a .bed.gz and checks that:

    * a .tbi is present
    * the VCF has ""##fileformat=VCF" as the first
    line
    * the VCF has a #CHROM header
    * the chromosome are in the order specified by
    the genome file (and present)
    * the positions are sorted
    * the positions are <= the chromosome lengths
    defined in the genome file.

As a result, any new genome going into GGD will have a .genome file that will dictate the sort order and presence or absence of the 'chr' prefix for chromosomes

Другие пакеты, относящиеся к ggd-utils

• dep: libc6 (>= 2.34)

  библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
  также виртуальный пакет, предоставляемый libc6-udeb

Загрузка ggd-utils

Загрузить для всех доступных архитектур

Архитектура	Версия	Размер пакета	В установленном виде	Файлы
amd64	1.0.0+ds-1+b12	2 113,8 Кб	6 191,0 Кб	[список файлов]
arm64	1.0.0+ds-1+b12	1 826,3 Кб	5 884,0 Кб	[список файлов]
armel	1.0.0+ds-1+b12	1 798,6 Кб	6 035,0 Кб	[список файлов]
armhf	1.0.0+ds-1+b12	1 792,8 Кб	6 035,0 Кб	[список файлов]
i386	1.0.0+ds-1+b12	1 953,0 Кб	5 991,0 Кб	[список файлов]
mips64el	1.0.0+ds-1+b12	1 635,5 Кб	6 734,0 Кб	[список файлов]
ppc64el	1.0.0+ds-1+b12	1 813,2 Кб	6 074,0 Кб	[список файлов]
riscv64	1.0.0+ds-1+b7	1 791,5 Кб	5 819,0 Кб	[список файлов]
s390x	1.0.0+ds-1+b12	1 922,3 Кб	6 523,0 Кб	[список файлов]