Пакунок: gmap (2024-11-20+ds-2)

Links for gmap

Debian Resources:

Download Source Package gmap:

Maintainers:

Debian Med Packaging Team (QA Page, Mail Archive)
Shaun Jackman (QA Page)
Andreas Tille (QA Page)
Alexandre Mestiashvili (QA Page)
Étienne Mollier (QA Page)

External Resources:

Homepage [research-pub.gene.com]

Similar packages:

spliced and SNP-tolerant alignment for mRNA and short reads

This package contains the programs GMAP and GSNAP as well as utilities to manage genome databases in GMAP/GSNAP format. GMAP (Genomic Mapping and Alignment Program) is a tool for aligning EST, mRNA and cDNA sequences. GSNAP (Genomic Short-read Nucleotide Alignment Program) is a tool for aligning single-end and paired-end transcriptome reads. Both tools can use a database of

 * known splice sites and identify novel splice sites.
 * known single-nucleotide polymorphisms (SNPs).

GSNAP can align bisulfite-treated DNA.

Tags: Field: Biology, field::biology:bioinformatics, field::biology:structural, Role: Program, Purpose: Analysing

Інші пакунки пов'язані з gmap

depends

recommends

suggests

enhances

dep: libbz2-1.0

Стискання файлів за алгоритмом Барроуза-Уїлера — виконавчий модуль
dep: libc6 (>= 2.34) [not alpha, loong64, sh4]

Бібліотека GNU C: спільні бібліотеки
also a virtual package provided by libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.40) [loong64, sh4]
dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

Бібліотека GNU C: спільні бібліотеки
also a virtual package provided by libc6.1-udeb
dep: perl

Мова Практичного Видобування та Побудування Звітів Лари Уолла (Larry Wall)
dep: zlib1g (>= 1:1.2.6)

Бібліотека стискання даних (виконавчий модуль)

Завантажити gmap

Завантаження для всіх доступних архітектур
Архітектура	Розмір пакунка	Розмір після встановлення	Файли
alpha (unofficial port)	5,233.2 kB	44,708.0 kB	[список файлів]
amd64	33,685.8 kB	268,823.0 kB	[список файлів]
arm64	6,907.0 kB	61,267.0 kB	[список файлів]
armel	4,919.1 kB	46,844.0 kB	[список файлів]
armhf	4,903.1 kB	44,860.0 kB	[список файлів]
i386	5,168.3 kB	46,588.0 kB	[список файлів]
loong64 (unofficial port)	6,969.7 kB	62,094.0 kB	[список файлів]
mips64el	5,960.0 kB	57,817.0 kB	[список файлів]
ppc64el	7,108.9 kB	63,635.0 kB	[список файлів]
riscv64	6,359.3 kB	59,311.0 kB	[список файлів]
sh4 (unofficial port)	5,697.4 kB	48,642.0 kB	[список файлів]
x32 (unofficial port)	5,639.4 kB	48,080.0 kB	[список файлів]