软件包:bwa(0.7.17-8~0exp) [debports]
试制(Experimental)软件包
警告:这个软件包来自于 experimental 发行版。这表示它很有可能表现出不稳定或者出现 bug ,甚至是导致资料损失。请务必在使用之前查阅 changelog 以及其他潜在的文档。
Burrows-Wheeler 比对工具
BWA 是一个用于将低差异序列比对到大型参考基因组(如人类基因组)的软件包。它包含三种算法:BWA-backtrack、BWA-SW 和 BWA-MEM。第一种算法适用于长度最多 100bp 的 Illumina 读段,而后两种算法适用于 70bp 至 1Mbp 之间的较长序列。BWA-MEM 和 BWA-SW 具有类似的特性,如对长读段的支持和分割比对,但 BWA-MEM 是最新的算法,通常推荐用于高质量的查询,因为它更快且更精确。此外,BWA-MEM 在处理 70-100bp 的 Illumina 读段时,比 BWA-backtrack 具有更好的性能。
其他与 bwa 有关的软件包
|
|
|
|
-
- dep: libc6 (>= 2.34) [riscv64]
- GNU C 语言运行库:共享库
同时作为一个虚包由这些包填实: libc6-udeb
-
- dep: libc6.1 (>= 2.36) [ia64]
- GNU C 语言运行库:共享库
同时作为一个虚包由这些包填实: libc6.1-udeb
-
- dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)
- 压缩库 - 运行时
-
- rec: perl
- 拉里 沃尔的实用报表提取语言(Perl)
-
- sug: samtools
- processing sequence alignments in SAM, BAM and CRAM formats