Пакет: bwa (0.7.17-8~0exp) [debports]

[ Источник:  ]

Экспериментальный пакет

Предупреждение: данный пакет находится в экспериментальной ветке дистрибутива. Это означает, что он нестабилен или содержит ошибки, и даже может вызвать потерю данных. Перед использованием внимательно прочитайте файл changelog и другую доступную документацию.

Burrows-Wheeler Aligner

BWA is a software package for mapping low-divergent sequences against a large reference genome, such as the human genome. It consists of three algorithms: BWA-backtrack, BWA-SW and BWA-MEM. The first algorithm is designed for Illumina sequence reads up to 100bp, while the rest two for longer sequences ranged from 70bp to 1Mbp. BWA-MEM and BWA-SW share similar features such as long-read support and split alignment, but BWA-MEM, which is the latest, is generally recommended for high-quality queries as it is faster and more accurate. BWA-MEM also has better performance than BWA-backtrack for 70-100bp Illumina reads.

Другие пакеты, относящиеся к bwa

• dep: libc6 (>= 2.34) [riscv64]

  библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
  также виртуальный пакет, предоставляемый libc6-udeb

• dep: libc6.1 (>= 2.36) [ia64]

  библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
  также виртуальный пакет, предоставляемый libc6.1-udeb

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  библиотека сжатия

• rec: perl

  практический язык Ларри Уолла для извлечения данных и составления отчётов

• sug: samtools

  processing sequence alignments in SAM, BAM and CRAM formats

Загрузка bwa

Загрузить для всех доступных архитектур

Архитектура	Размер пакета	В установленном виде	Файлы
ia64 (неофициальный перенос)	291,1 Кб	962,0 Кб	[список файлов]
riscv64 (неофициальный перенос)	200,8 Кб	345,0 Кб	[список файлов]