Пакет: bwa (0.7.17-8~0exp и другие)
Ссылки для bwa
Ресурсы Debian:
- Сообщения об ошибках
- Developer Information
- Debian журнал изменений
- Файл авторских прав
- Отслеживание заплат Debian
Исходный код bwa:
Сопровождающие:
- Debian Med Packaging Team (Страница КК, Почтовый архив)
- Charles Plessy (Страница КК)
- Andreas Tille (Страница КК)
- Carlos Borroto (Страница КК)
- Ognyan Kulev (Страница КК)
- Michael R. Crusoe (Страница КК)
Внешние ресурсы:
- Сайт [bio-bwa.sourceforge.net]
Подобные пакеты:
Экспериментальный пакет
Предупреждение: данный пакет находится в экспериментальной ветке дистрибутива. Это означает, что он нестабилен или содержит ошибки, и даже может вызвать потерю данных. Перед использованием внимательно прочитайте файл changelog и другую доступную документацию.
Burrows-Wheeler Aligner
BWA is a software package for mapping low-divergent sequences against a large reference genome, such as the human genome. It consists of three algorithms: BWA-backtrack, BWA-SW and BWA-MEM. The first algorithm is designed for Illumina sequence reads up to 100bp, while the rest two for longer sequences ranged from 70bp to 1Mbp. BWA-MEM and BWA-SW share similar features such as long-read support and split alignment, but BWA-MEM, which is the latest, is generally recommended for high-quality queries as it is faster and more accurate. BWA-MEM also has better performance than BWA-backtrack for 70-100bp Illumina reads.
Другие пакеты, относящиеся к bwa
|
|
|
|
-
- dep: libc6 (>= 2.34) [не alpha, ia64, sh4]
- библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
также виртуальный пакет, предоставляемый libc6-udeb
- dep: libc6 (>= 2.36) [sh4]
-
- dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]
- библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
также виртуальный пакет, предоставляемый libc6.1-udeb
- dep: libc6.1 (>= 2.36) [ia64]
-
- dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)
- библиотека сжатия
-
- rec: perl
- практический язык Ларри Уолла для извлечения данных и составления отчётов
-
- sug: samtools
- processing sequence alignments in SAM, BAM and CRAM formats
Загрузка bwa
Архитектура | Версия | Размер пакета | В установленном виде | Файлы |
---|---|---|---|---|
alpha (неофициальный перенос) | 0.7.17-8~0exp | 222,1 Кб | 577,0 Кб | [список файлов] |
amd64 | 0.7.17-8~0exp | 207,2 Кб | 452,0 Кб | [список файлов] |
arm64 | 0.7.17-8~0exp | 188,8 Кб | 448,0 Кб | [список файлов] |
armel | 0.7.17-8~0exp | 190,6 Кб | 431,0 Кб | [список файлов] |
armhf | 0.7.17-8~0exp | 190,1 Кб | 319,0 Кб | [список файлов] |
hppa (неофициальный перенос) | 0.7.17-8~0exp | 225,9 Кб | 512,0 Кб | [список файлов] |
i386 | 0.7.17-8~0exp | 231,7 Кб | 523,0 Кб | [список файлов] |
ia64 (неофициальный перенос) | 0.7.17-8~0exp | 291,1 Кб | 962,0 Кб | [список файлов] |
m68k (неофициальный перенос) | 0.7.17-8~0exp | 203,9 Кб | 471,0 Кб | [список файлов] |
mips64el | 0.7.17-8~0exp | 201,2 Кб | 527,0 Кб | [список файлов] |
ppc64 (неофициальный перенос) | 0.7.17-8~0exp | 216,9 Кб | 576,0 Кб | [список файлов] |
ppc64el | 0.7.17-8~0exp | 226,8 Кб | 576,0 Кб | [список файлов] |
riscv64 | 0.7.17-8~0exp+b1 | 214,5 Кб | 376,0 Кб | [список файлов] |
s390x | 0.7.17-8~0exp | 190,3 Кб | 464,0 Кб | [список файлов] |
sh4 (неофициальный перенос) | 0.7.17-8~0exp | 272,9 Кб | 448,0 Кб | [список файлов] |
sparc64 (неофициальный перенос) | 0.7.17-8~0exp | 182,5 Кб | 1 092,0 Кб | [список файлов] |
x32 (неофициальный перенос) | 0.7.17-8~0exp | 218,3 Кб | 471,0 Кб | [список файлов] |