Package: bwa (0.7.17-8~0exp) [debports]

[ Source:  ]

Experimental package

Warning: This package is from the experimental distribution. That means it is likely unstable or buggy, and it may even cause data loss. Please be sure to consult the changelog and other possible documentation before using it.

Burrows-Wheeler Aligner

BWA è un pacchetto software per mappare sequenze con bassa divergenza rispetto a vasti genomi di riferimento, come il genoma umano. Consiste di tre algoritmi: BWA-backtrack, BWA-SW e BWA-MEM. Il primo è progettato per sequenze Illumina fino a 100pb, mentre gli altri due per sequenze più lunghe da 70pb a 1Mpb. BWA-MEM e BWA-SH condividono funzionalità simili, come gestione per lunghe sequenze e allineamenti spezzati, ma BWA-MEM, che è il più recente, è generalmente quello raccomandato per interrogazioni di alta qualità perché più veloce e più accurato. BWA-MEM ha prestazioni migliori anche rispetto a BWA-backtrack per sequenze Illumina 70-100pb.

Other Packages Related to bwa

• dep: libc6 (>= 2.34) [riscv64]

  Libreria C GNU: librerie condivise
  also a virtual package provided by libc6-udeb

• dep: libc6.1 (>= 2.36) [ia64]

  Libreria C GNU: librerie condivise
  also a virtual package provided by libc6.1-udeb

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  libreria di compressione - runtime

• rec: perl

  "Practical Extraction and Report Language" di Larry Wall

• sug: samtools

  elaborazioni di allineamenti di sequenze nei formati SAM, BAM e CRAM

Download bwa

Download for all available architectures

Architecture	Package Size	Installed Size	Files
ia64 (unofficial port)	291.1 kB	962.0 kB	[list of files]
riscv64 (unofficial port)	200.8 kB	345.0 kB	[list of files]