Pakiet: kalign (1:3.4.0-1 i inne)

[ Pakiet źródłowy: kalign  ]

Globalne i progresywne dopasowywanie wielu sekwencji

Kalign jest narzędziem wiersza poleceń do przeprowadzenia wielokrotnego dopasowywania sekwencji biologicznych. Wykorzystuje algorytm dopasowywania ciągów Mutha-Manbera do poprawiania zarówno dokładności, jak i szybkości wyrównywania. Program wykorzystuje globalne, progresywne podejście do dopasowywania, wzbogacone o zastosowanie przybliżonego algorytmu dopasowywania ciągów do obliczania odległości sekwencji oraz poprzez włączenie lokalnych dopasowań do globalnego wyrównywania.

Znaczniki: Biologia: Clustal/ALN, Białka, Dziedzina: field::biology, field::biology:bioinformatics, Zaimplementowane w: implemented-in::c, interface::commandline, Rola: Program, Zakres: Narzędzie, Przeznaczenie: use::comparing, works-with-format::plaintext, Działa z: Wymaga dodatkowego znacznika

Inne pakiety związane z kalign

• dep: libc6 (>= 2.34) [nie alpha, ia64, loong64, sh4]

  Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
  również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.40) [loong64, sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

  Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
  również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

• dep: libgomp1 (>= 4.9)

  Biblioteka wspierająca GCC OpenMP (GOMP)

• enh: bioperl-run

  Nakładki na BioPerl: skrypty

• enh: t-coffee

  Wielosekwencyjne wyrównanie

Pobieranie kalign

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur

Architektura	Wersja	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
alpha (port nieoficjalny)	1:3.4.0-1+b2	85,7 KiB	409,0 KiB	[lista plików]
amd64	1:3.4.0-1+b3	134,6 KiB	1 127,0 KiB	[lista plików]
arm64	1:3.4.0-1+b3	87,0 KiB	407,0 KiB	[lista plików]
armel	1:3.4.0-1+b3	80,1 KiB	405,0 KiB	[lista plików]
armhf	1:3.4.0-1+b3	77,6 KiB	277,0 KiB	[lista plików]
hppa (port nieoficjalny)	1:3.4.0-1+b2	83,4 KiB	324,0 KiB	[lista plików]
i386	1:3.4.0-1+b3	88,8 KiB	341,0 KiB	[lista plików]
ia64 (port nieoficjalny)	1:3.4.0-1	105,1 KiB	557,0 KiB	[lista plików]
loong64 (port nieoficjalny)	1:3.4.0-1+b2	95,7 KiB	407,0 KiB	[lista plików]
m68k (port nieoficjalny)	1:3.4.0-1+b2	80,6 KiB	293,0 KiB	[lista plików]
mips64el	1:3.4.0-1+b3	84,1 KiB	421,0 KiB	[lista plików]
ppc64 (port nieoficjalny)	1:3.4.0-1+b2	92,3 KiB	471,0 KiB	[lista plików]
ppc64el	1:3.4.0-1+b3	99,9 KiB	471,0 KiB	[lista plików]
riscv64	1:3.4.0-1+b3	88,2 KiB	287,0 KiB	[lista plików]
s390x	1:3.4.0-1+b3	96,4 KiB	371,0 KiB	[lista plików]
sh4 (port nieoficjalny)	1:3.4.0-1+b2	88,8 KiB	277,0 KiB	[lista plików]
sparc64 (port nieoficjalny)	1:3.4.0-1+b2	75,2 KiB	2 138,0 KiB	[lista plików]
x32 (port nieoficjalny)	1:3.4.0-1+b2	90,2 KiB	329,0 KiB	[lista plików]