Pakiet: kalign (1:3.3-1 i inne)

[ Pakiet źródłowy: kalign  ]

Globalne i progresywne dopasowywanie wielu sekwencji

Kalign jest narzędziem wiersza poleceń do przeprowadzenia wielokrotnego dopasowywania sekwencji biologicznych. Wykorzystuje algorytm dopasowywania ciągów Mutha-Manbera do poprawiania zarówno dokładności, jak i szybkości wyrównywania. Program wykorzystuje globalne, progresywne podejście do dopasowywania, wzbogacone o zastosowanie przybliżonego algorytmu dopasowywania ciągów do obliczania odległości sekwencji oraz poprzez włączenie lokalnych dopasowań do globalnego wyrównywania.

Znaczniki: Biologia: Clustal/ALN, Białka, Dziedzina: field::biology, field::biology:bioinformatics, Zaimplementowane w: implemented-in::c, interface::commandline, Rola: Program, Zakres: Narzędzie, Przeznaczenie: use::comparing, works-with-format::plaintext, Działa z: Wymaga dodatkowego znacznika

Inne pakiety związane z kalign

• dep: libc6 (>= 2.29)

  Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
  również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb

• dep: libgomp1 (>= 6)

  Biblioteka wspierająca GCC OpenMP (GOMP)

• enh: bioperl-run

  Nakładki na BioPerl: skrypty

• enh: t-coffee

  Wielosekwencyjne wyrównanie

Pobieranie kalign

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur

Architektura	Wersja	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
amd64	1:3.3-1+b3	133,4 KiB	1 144,0 KiB	[lista plików]
arm64	1:3.3-1+b3	72,2 KiB	217,0 KiB	[lista plików]
armel	1:3.3-1+b3	70,2 KiB	207,0 KiB	[lista plików]
armhf	1:3.3-1+b3	67,5 KiB	171,0 KiB	[lista plików]
i386	1:3.3-1+b3	173,4 KiB	1 572,0 KiB	[lista plików]
mips64el	1:3.3-1+b3	71,1 KiB	223,0 KiB	[lista plików]
mipsel	1:3.3-1+b3	71,7 KiB	216,0 KiB	[lista plików]
ppc64el	1:3.3-1+b3	85,0 KiB	341,0 KiB	[lista plików]
s390x	1:3.3-1+b3	73,3 KiB	241,0 KiB	[lista plików]