Пакунок: kalign (1:3.4.0-1 and others)

[ Source: kalign  ]

Global and progressive multiple sequence alignment

Kalign is a command line tool to perform multiple alignment of biological sequences. It employs the Muth-Manber string-matching algorithm, to improve both the accuracy and speed of the alignment. It uses global, progressive alignment approach, enriched by employing an approximate string-matching algorithm to calculate sequence distances and by incorporating local matches into the otherwise global alignment.

Tags: Biology: Clustal/ALN, Proteins, Field: field::biology, field::biology:bioinformatics, Implemented in: implemented-in::c, interface::commandline, Role: Program, Scope: Utility, Purpose: use::comparing, works-with-format::plaintext, Works with: Need an extra tag

Інші пакунки пов'язані з kalign

• dep: libc6 (>= 2.34) [not alpha, ia64, loong64, sh4]

  Бібліотека GNU C: спільні бібліотеки
  also a virtual package provided by libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.40) [loong64, sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

  Бібліотека GNU C: спільні бібліотеки
  also a virtual package provided by libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

• dep: libgomp1 (>= 4.9)

  Підтримувальна бібліотека GCC OpenMP (GOMP)

• enh: bioperl-run

  BioPerl wrappers: scripts

• enh: t-coffee

  Multiple Sequence Alignment

Завантажити kalign

Завантаження для всіх доступних архітектур

Архітектура	Версія	Розмір пакунка	Розмір після встановлення	Файли
alpha (unofficial port)	1:3.4.0-1+b2	85.7 kB	409.0 kB	[список файлів]
amd64	1:3.4.0-1+b3	134.6 kB	1,127.0 kB	[список файлів]
arm64	1:3.4.0-1+b3	87.0 kB	407.0 kB	[список файлів]
armel	1:3.4.0-1+b3	80.1 kB	405.0 kB	[список файлів]
armhf	1:3.4.0-1+b3	77.6 kB	277.0 kB	[список файлів]
hppa (unofficial port)	1:3.4.0-1+b2	83.4 kB	324.0 kB	[список файлів]
i386	1:3.4.0-1+b3	88.8 kB	341.0 kB	[список файлів]
ia64 (unofficial port)	1:3.4.0-1	105.1 kB	557.0 kB	[список файлів]
loong64 (unofficial port)	1:3.4.0-1+b2	95.7 kB	407.0 kB	[список файлів]
m68k (unofficial port)	1:3.4.0-1+b2	80.6 kB	293.0 kB	[список файлів]
mips64el	1:3.4.0-1+b3	84.1 kB	421.0 kB	[список файлів]
ppc64 (unofficial port)	1:3.4.0-1+b2	92.3 kB	471.0 kB	[список файлів]
ppc64el	1:3.4.0-1+b3	99.9 kB	471.0 kB	[список файлів]
riscv64	1:3.4.0-1+b3	88.2 kB	287.0 kB	[список файлів]
s390x	1:3.4.0-1+b3	96.4 kB	371.0 kB	[список файлів]
sh4 (unofficial port)	1:3.4.0-1+b2	88.8 kB	277.0 kB	[список файлів]
sparc64 (unofficial port)	1:3.4.0-1+b2	75.2 kB	2,138.0 kB	[список файлів]
x32 (unofficial port)	1:3.4.0-1+b2	90.2 kB	329.0 kB	[список файлів]