Paket: kalign (1:3.4.0-1 och andra)

[ Källkod: kalign  ]

Global and progressive multiple sequence alignment

Kalign is a command line tool to perform multiple alignment of biological sequences. It employs the Muth-Manber string-matching algorithm, to improve both the accuracy and speed of the alignment. It uses global, progressive alignment approach, enriched by employing an approximate string-matching algorithm to calculate sequence distances and by incorporating local matches into the otherwise global alignment.

Märken: Biologi: Clustal/ALN, Proteiner, Field: field::biology, field::biology:bioinformatics, Implemented in: implemented-in::c, interface::commandline, Role: Program, Scope: Utility, Purpose: use::comparing, works-with-format::plaintext, Works with: Behöver ett märke till

Andra paket besläktade med kalign

• dep: libc6 (>= 2.34) [ej alpha, ia64, sh4]

  GNU C-bibliotek: Delade bibliotek
  också ett virtuellt paket som tillhandahålls av libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.40) [sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

  GNU C-bibliotek: Delade bibliotek
  också ett virtuellt paket som tillhandahålls av libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

• dep: libgomp1 (>= 4.9)

  GCC OpenMP (GOMP) support library

• enh: bioperl-run

  BioPerl wrappers: scripts

• enh: t-coffee

  Multiple Sequence Alignment

Hämta kalign

Hämtningar för alla tillgängliga arkitekturer

Arkitektur	Version	Paketstorlek	Installerad storlek	Filer
alpha (inofficiell anpassning)	1:3.4.0-1+b1	85,7 kbyte	409,0 kbyte	[filförteckning]
amd64	1:3.4.0-1+b2	134,6 kbyte	1.127,0 kbyte	[filförteckning]
arm64	1:3.4.0-1+b2	86,9 kbyte	407,0 kbyte	[filförteckning]
armel	1:3.4.0-1+b2	79,3 kbyte	405,0 kbyte	[filförteckning]
armhf	1:3.4.0-1+b2	76,2 kbyte	277,0 kbyte	[filförteckning]
hppa (inofficiell anpassning)	1:3.4.0-1+b2	83,4 kbyte	324,0 kbyte	[filförteckning]
i386	1:3.4.0-1+b2	88,7 kbyte	341,0 kbyte	[filförteckning]
ia64 (inofficiell anpassning)	1:3.4.0-1	105,1 kbyte	557,0 kbyte	[filförteckning]
m68k (inofficiell anpassning)	1:3.4.0-1+b2	80,6 kbyte	293,0 kbyte	[filförteckning]
mips64el	1:3.4.0-1+b2	84,1 kbyte	421,0 kbyte	[filförteckning]
ppc64 (inofficiell anpassning)	1:3.4.0-1+b2	92,3 kbyte	471,0 kbyte	[filförteckning]
ppc64el	1:3.4.0-1+b2	100,0 kbyte	471,0 kbyte	[filförteckning]
riscv64	1:3.4.0-1+b2	88,3 kbyte	287,0 kbyte	[filförteckning]
s390x	1:3.4.0-1+b2	96,5 kbyte	371,0 kbyte	[filförteckning]
sh4 (inofficiell anpassning)	1:3.4.0-1+b2	88,8 kbyte	277,0 kbyte	[filförteckning]
sparc64 (inofficiell anpassning)	1:3.4.0-1+b2	75,2 kbyte	2.138,0 kbyte	[filförteckning]
x32 (inofficiell anpassning)	1:3.4.0-1+b2	90,2 kbyte	329,0 kbyte	[filförteckning]