Pacote: kalign (1:3.4.0-1 e outros)

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Mantenedores(as):

Fontes externas:

Pagina principal [msa.sbc.su.se]

Pacotes similares:

Global and progressive multiple sequence alignment

Kalign is a command line tool to perform multiple alignment of biological sequences. It employs the Muth-Manber string-matching algorithm, to improve both the accuracy and speed of the alignment. It uses global, progressive alignment approach, enriched by employing an approximate string-matching algorithm to calculate sequence distances and by incorporating local matches into the otherwise global alignment.

Etiquetas: Biologia: Clustal/ALN, Proteínas, Campo: field::biology, field::biology:bioinformatics, Implementado em: implemented-in::c, interface::commandline, Função: Programa, Alcance: Utilitários, Propósito: use::comparing, works-with-format::plaintext, Funciona com: Precisa de uma etiqueta extra

Outros pacotes relacionados a kalign

depende

recomenda

sugere

melhora

dep: libc6 (>= 2.34) [não alpha, ia64, loong64, sh4]

GNU Biblioteca C: Bibliotecas compartilhadas
também um pacote virtual fornecido por libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.40) [loong64, sh4]
dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

GNU Biblioteca C: Bibliotecas compartilhadas
também um pacote virtual fornecido por libc6.1-udeb

dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]
dep: libgomp1 (>= 4.9)

biblioteca de suporte ao GCC OpenMP (GOMP)

enh: bioperl-run

BioPerl wrappers: scripts
enh: t-coffee

Multiple Sequence Alignment

Download de kalign

Baixe para todas as arquiteturas disponíveis
Arquitetura	Versão	Tamanho do pacote	Tamanho instalado	Arquivos
alpha (porte não oficial)	1:3.4.0-1+b2	85.7 kB	409.0 kB	[lista de arquivos]
amd64	1:3.4.0-1+b3	134.6 kB	1,127.0 kB	[lista de arquivos]
arm64	1:3.4.0-1+b3	87.0 kB	407.0 kB	[lista de arquivos]
armel	1:3.4.0-1+b3	80.1 kB	405.0 kB	[lista de arquivos]
armhf	1:3.4.0-1+b3	77.6 kB	277.0 kB	[lista de arquivos]
hppa (porte não oficial)	1:3.4.0-1+b2	83.4 kB	324.0 kB	[lista de arquivos]
i386	1:3.4.0-1+b3	88.8 kB	341.0 kB	[lista de arquivos]
ia64 (porte não oficial)	1:3.4.0-1	105.1 kB	557.0 kB	[lista de arquivos]
loong64 (porte não oficial)	1:3.4.0-1+b2	95.7 kB	407.0 kB	[lista de arquivos]
m68k (porte não oficial)	1:3.4.0-1+b2	80.6 kB	293.0 kB	[lista de arquivos]
mips64el	1:3.4.0-1+b3	84.1 kB	421.0 kB	[lista de arquivos]
ppc64 (porte não oficial)	1:3.4.0-1+b2	92.3 kB	471.0 kB	[lista de arquivos]
ppc64el	1:3.4.0-1+b3	99.9 kB	471.0 kB	[lista de arquivos]
riscv64	1:3.4.0-1+b3	88.2 kB	287.0 kB	[lista de arquivos]
s390x	1:3.4.0-1+b3	96.4 kB	371.0 kB	[lista de arquivos]
sh4 (porte não oficial)	1:3.4.0-1+b2	88.8 kB	277.0 kB	[lista de arquivos]
sparc64 (porte não oficial)	1:3.4.0-1+b2	75.2 kB	2,138.0 kB	[lista de arquivos]
x32 (porte não oficial)	1:3.4.0-1+b2	90.2 kB	329.0 kB	[lista de arquivos]