Pakket: kalign (1:3.4.0-1 en anderen)

Verwijzigingen voor kalign

Debian bronnen:

Het bronpakket kalign downloaden:

Beheerders:

Externe bronnen:

Homepage [msa.sbc.su.se]

Vergelijkbare pakketten:

Global and progressive multiple sequence alignment

Kalign is a command line tool to perform multiple alignment of biological sequences. It employs the Muth-Manber string-matching algorithm, to improve both the accuracy and speed of the alignment. It uses global, progressive alignment approach, enriched by employing an approximate string-matching algorithm to calculate sequence distances and by incorporating local matches into the otherwise global alignment.

Tags: Biology: Clustal/ALN, Proteins, Field: field::biology, field::biology:bioinformatics, Implemented in: implemented-in::c, interface::commandline, Role: Program, Scope: Utility, Purpose: use::comparing, works-with-format::plaintext, Works with: Need an extra tag

Andere aan kalign gerelateerde pakketten

depends

recommends

suggests

enhances

dep: libc6 (>= 2.34) [niet alpha, ia64, loong64, sh4]

GNU C Bibliotheek: Gedeelde bibliotheken
Ook een virtueel pakket geboden door: libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.40) [loong64, sh4]
dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

GNU C Bibliotheek: Gedeelde bibliotheken
Ook een virtueel pakket geboden door: libc6.1-udeb

dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]
dep: libgomp1 (>= 4.9)

GCC OpenMP (GOMP) support library

enh: bioperl-run

BioPerl wrappers: scripts
enh: t-coffee

Multiple Sequence Alignment

kalign downloaden

Pakket downloaden voor alle beschikbare platforms
Platform	Versie	Pakketgrootte	Geïnstalleerde grootte	Bestanden
alpha (unofficial port)	1:3.4.0-1+b2	85,7 kB	409,0 kB	[overzicht]
amd64	1:3.4.0-1+b3	134,6 kB	1.127,0 kB	[overzicht]
arm64	1:3.4.0-1+b3	87,0 kB	407,0 kB	[overzicht]
armel	1:3.4.0-1+b3	80,1 kB	405,0 kB	[overzicht]
armhf	1:3.4.0-1+b3	77,6 kB	277,0 kB	[overzicht]
hppa (unofficial port)	1:3.4.0-1+b2	83,4 kB	324,0 kB	[overzicht]
i386	1:3.4.0-1+b3	88,8 kB	341,0 kB	[overzicht]
ia64 (unofficial port)	1:3.4.0-1	105,1 kB	557,0 kB	[overzicht]
loong64 (unofficial port)	1:3.4.0-1+b2	95,7 kB	407,0 kB	[overzicht]
m68k (unofficial port)	1:3.4.0-1+b2	80,6 kB	293,0 kB	[overzicht]
mips64el	1:3.4.0-1+b3	84,1 kB	421,0 kB	[overzicht]
ppc64 (unofficial port)	1:3.4.0-1+b2	92,3 kB	471,0 kB	[overzicht]
ppc64el	1:3.4.0-1+b3	99,9 kB	471,0 kB	[overzicht]
riscv64	1:3.4.0-1+b3	88,2 kB	287,0 kB	[overzicht]
s390x	1:3.4.0-1+b3	96,4 kB	371,0 kB	[overzicht]
sh4 (unofficial port)	1:3.4.0-1+b2	88,8 kB	277,0 kB	[overzicht]
sparc64 (unofficial port)	1:3.4.0-1+b2	75,2 kB	2.138,0 kB	[overzicht]
x32 (unofficial port)	1:3.4.0-1+b2	90,2 kB	329,0 kB	[overzicht]