Пакет: kalign (1:3.4.0-1 и другие)

[ Источник: kalign  ]

Global and progressive multiple sequence alignment

Kalign is a command line tool to perform multiple alignment of biological sequences. It employs the Muth-Manber string-matching algorithm, to improve both the accuracy and speed of the alignment. It uses global, progressive alignment approach, enriched by employing an approximate string-matching algorithm to calculate sequence distances and by incorporating local matches into the otherwise global alignment.

Теги: Биология: Clustal/ALN, Протеины, Область: field::biology, field::biology:bioinformatics, Реализовано на: implemented-in::c, interface::commandline, Роль: Программа, Область: Утилита, Цель: use::comparing, works-with-format::plaintext, Работает с: Требуется дополнительный тег

Другие пакеты, относящиеся к kalign

• dep: libc6 (>= 2.34) [не alpha, ia64, sh4]

  библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
  также виртуальный пакет, предоставляемый libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.40) [sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

  библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
  также виртуальный пакет, предоставляемый libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

• dep: libgomp1 (>= 4.9)

  вспомогательная библиотека GCC OpenMP (GOMP)

• enh: bioperl-run

  BioPerl wrappers: scripts

• enh: t-coffee

  Multiple Sequence Alignment

Загрузка kalign

Загрузить для всех доступных архитектур

Архитектура	Версия	Размер пакета	В установленном виде	Файлы
alpha (неофициальный перенос)	1:3.4.0-1+b1	85,7 Кб	409,0 Кб	[список файлов]
amd64	1:3.4.0-1+b2	134,6 Кб	1 127,0 Кб	[список файлов]
arm64	1:3.4.0-1+b2	86,9 Кб	407,0 Кб	[список файлов]
armel	1:3.4.0-1+b2	79,3 Кб	405,0 Кб	[список файлов]
armhf	1:3.4.0-1+b2	76,2 Кб	277,0 Кб	[список файлов]
hppa (неофициальный перенос)	1:3.4.0-1+b2	83,4 Кб	324,0 Кб	[список файлов]
i386	1:3.4.0-1+b2	88,7 Кб	341,0 Кб	[список файлов]
ia64 (неофициальный перенос)	1:3.4.0-1	105,1 Кб	557,0 Кб	[список файлов]
m68k (неофициальный перенос)	1:3.4.0-1+b2	80,6 Кб	293,0 Кб	[список файлов]
mips64el	1:3.4.0-1+b2	84,1 Кб	421,0 Кб	[список файлов]
ppc64 (неофициальный перенос)	1:3.4.0-1+b2	92,3 Кб	471,0 Кб	[список файлов]
ppc64el	1:3.4.0-1+b2	100,0 Кб	471,0 Кб	[список файлов]
riscv64	1:3.4.0-1+b2	88,3 Кб	287,0 Кб	[список файлов]
s390x	1:3.4.0-1+b2	96,5 Кб	371,0 Кб	[список файлов]
sh4 (неофициальный перенос)	1:3.4.0-1+b2	88,8 Кб	277,0 Кб	[список файлов]
sparc64 (неофициальный перенос)	1:3.4.0-1+b2	75,2 Кб	2 138,0 Кб	[список файлов]
x32 (неофициальный перенос)	1:3.4.0-1+b2	90,2 Кб	329,0 Кб	[список файлов]