Pakiet: kalign (1:3.4.0-1)

[ Pakiet źródłowy: kalign  ]

Globalne i progresywne dopasowywanie wielu sekwencji

Kalign jest narzędziem wiersza poleceń do przeprowadzenia wielokrotnego dopasowywania sekwencji biologicznych. Wykorzystuje algorytm dopasowywania ciągów Mutha-Manbera do poprawiania zarówno dokładności, jak i szybkości wyrównywania. Program wykorzystuje globalne, progresywne podejście do dopasowywania, wzbogacone o zastosowanie przybliżonego algorytmu dopasowywania ciągów do obliczania odległości sekwencji oraz poprzez włączenie lokalnych dopasowań do globalnego wyrównywania.

Znaczniki: Biologia: Clustal/ALN, Białka, Dziedzina: field::biology, field::biology:bioinformatics, Zaimplementowane w: implemented-in::c, interface::commandline, Rola: Program, Zakres: Narzędzie, Przeznaczenie: use::comparing, works-with-format::plaintext, Działa z: Wymaga dodatkowego znacznika

Inne pakiety związane z kalign

• dep: libc6 (>= 2.34)

  Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
  również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb

• dep: libgomp1 (>= 4.9)

  Biblioteka wspierająca GCC OpenMP (GOMP)

• enh: bioperl-run

  Nakładki na BioPerl: skrypty

• enh: t-coffee

  Wielosekwencyjne wyrównanie

Pobieranie kalign

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur

Architektura	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
amd64	134,4 KiB	1 126,0 KiB	[lista plików]
arm64	83,7 KiB	406,0 KiB	[lista plików]
armel	79,2 KiB	304,0 KiB	[lista plików]
armhf	76,9 KiB	244,0 KiB	[lista plików]
i386	88,1 KiB	340,0 KiB	[lista plików]
mips64el	82,0 KiB	420,0 KiB	[lista plików]
ppc64el	99,4 KiB	470,0 KiB	[lista plików]
s390x	96,2 KiB	370,0 KiB	[lista plików]