Balík: kalign (1:3.4.0-1 a iné)

[ Zdroj: kalign  ]

Global and progressive multiple sequence alignment

Kalign is a command line tool to perform multiple alignment of biological sequences. It employs the Muth-Manber string-matching algorithm, to improve both the accuracy and speed of the alignment. It uses global, progressive alignment approach, enriched by employing an approximate string-matching algorithm to calculate sequence distances and by incorporating local matches into the otherwise global alignment.

Značky: Biológia: Clustal/ALN, Proteins, Pole: field::biology, field::biology:bioinformatics, Implementované v: implemented-in::c, interface::commandline, Role: Program, Scope: Utility, Purpose: use::comparing, works-with-format::plaintext, Works with: Need an extra tag

Ostatné balíky súvisiace s balíkom kalign

• dep: libc6 (>= 2.34) [nie alpha, ia64, sh4]

  knižnica GNU C - zdieľané knižnice
  tiež virtuálny balík poskytovaný balíkom libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.39) [sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

  knižnica GNU C - zdieľané knižnice
  tiež virtuálny balík poskytovaný balíkom libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

• dep: libgomp1 (>= 4.9)

  podporná knižnica GCC OpenMP (GOMP)

• enh: bioperl-run

  BioPerl wrappers: scripts

• enh: t-coffee

  Multiple Sequence Alignment

Stiahnuť kalign

Stiahnuť pre všetky dostupné architektúry

Architektúra	Verzia	Veľkosť balíka	Nainštalovaná veľkosť	Súbory
alpha (neoficiálny port)	1:3.4.0-1+b1	85.7 kB	409.0 kB	[zoznam súborov]
amd64	1:3.4.0-1+b1	134.3 kB	1,127.0 kB	[zoznam súborov]
arm64	1:3.4.0-1+b1	86.8 kB	407.0 kB	[zoznam súborov]
armel	1:3.4.0-1+b1	79.9 kB	305.0 kB	[zoznam súborov]
armhf	1:3.4.0-1+b1	77.4 kB	245.0 kB	[zoznam súborov]
hppa (neoficiálny port)	1:3.4.0-1+b1	83.3 kB	324.0 kB	[zoznam súborov]
i386	1:3.4.0-1+b1	88.8 kB	341.0 kB	[zoznam súborov]
ia64 (neoficiálny port)	1:3.4.0-1	105.1 kB	557.0 kB	[zoznam súborov]
m68k (neoficiálny port)	1:3.4.0-1+b1	80.5 kB	293.0 kB	[zoznam súborov]
mips64el	1:3.4.0-1+b1	84.1 kB	421.0 kB	[zoznam súborov]
ppc64 (neoficiálny port)	1:3.4.0-1+b1	92.4 kB	471.0 kB	[zoznam súborov]
ppc64el	1:3.4.0-1+b1	99.9 kB	471.0 kB	[zoznam súborov]
riscv64	1:3.4.0-1+b1	88.3 kB	287.0 kB	[zoznam súborov]
s390x	1:3.4.0-1+b1	96.4 kB	371.0 kB	[zoznam súborov]
sh4 (neoficiálny port)	1:3.4.0-1+b1	88.8 kB	278.0 kB	[zoznam súborov]
sparc64 (neoficiálny port)	1:3.4.0-1+b1	75.0 kB	2,138.0 kB	[zoznam súborov]
x32 (neoficiálny port)	1:3.4.0-1+b1	90.2 kB	329.0 kB	[zoznam súborov]