Пакет: kalign (1:3.4.0-1 и други)

[ Източник: kalign  ]

Global and progressive multiple sequence alignment

Kalign is a command line tool to perform multiple alignment of biological sequences. It employs the Muth-Manber string-matching algorithm, to improve both the accuracy and speed of the alignment. It uses global, progressive alignment approach, enriched by employing an approximate string-matching algorithm to calculate sequence distances and by incorporating local matches into the otherwise global alignment.

Етикети: Biology: Clustal/ALN, Proteins, Field: field::biology, field::biology:bioinformatics, Implemented in: implemented-in::c, interface::commandline, Role: Program, Scope: Utility, Purpose: use::comparing, works-with-format::plaintext, Works with: Need an extra tag

Други пакети, свързани с kalign

• dep: libc6 (>= 2.34) [не alpha, ia64, sh4]

  GNU C Library: Shared libraries
  също и виртуален пакет, предлаган от libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.40) [sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

  GNU C Library: Shared libraries
  също и виртуален пакет, предлаган от libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

• dep: libgomp1 (>= 4.9)

  GCC OpenMP (GOMP) support library

• enh: bioperl-run

  BioPerl wrappers: scripts

• enh: t-coffee

  Multiple Sequence Alignment

Изтегляне на kalign

Изтегляне за всички налични архитектури

Архитектура	Версия	Големина на пакета	Големина след инсталиране	Файлове
alpha (неофициална архитектура)	1:3.4.0-1+b1	85,7 кБ	409,0 кБ	[списък на файловете]
amd64	1:3.4.0-1+b2	134,6 кБ	1 127,0 кБ	[списък на файловете]
arm64	1:3.4.0-1+b2	86,9 кБ	407,0 кБ	[списък на файловете]
armel	1:3.4.0-1+b2	79,3 кБ	405,0 кБ	[списък на файловете]
armhf	1:3.4.0-1+b2	76,2 кБ	277,0 кБ	[списък на файловете]
hppa (неофициална архитектура)	1:3.4.0-1+b2	83,4 кБ	324,0 кБ	[списък на файловете]
i386	1:3.4.0-1+b2	88,7 кБ	341,0 кБ	[списък на файловете]
ia64 (неофициална архитектура)	1:3.4.0-1	105,1 кБ	557,0 кБ	[списък на файловете]
m68k (неофициална архитектура)	1:3.4.0-1+b2	80,6 кБ	293,0 кБ	[списък на файловете]
mips64el	1:3.4.0-1+b2	84,1 кБ	421,0 кБ	[списък на файловете]
ppc64 (неофициална архитектура)	1:3.4.0-1+b2	92,3 кБ	471,0 кБ	[списък на файловете]
ppc64el	1:3.4.0-1+b2	100,0 кБ	471,0 кБ	[списък на файловете]
riscv64	1:3.4.0-1+b2	88,3 кБ	287,0 кБ	[списък на файловете]
s390x	1:3.4.0-1+b2	96,5 кБ	371,0 кБ	[списък на файловете]
sh4 (неофициална архитектура)	1:3.4.0-1+b2	88,8 кБ	277,0 кБ	[списък на файловете]
sparc64 (неофициална архитектура)	1:3.4.0-1+b2	75,2 кБ	2 138,0 кБ	[списък на файловете]
x32 (неофициална архитектура)	1:3.4.0-1+b2	90,2 кБ	329,0 кБ	[списък на файловете]