Paket: kalign (1:3.4.0-1 ve diğerleri)

[ Kaynak: kalign  ]

Global and progressive multiple sequence alignment

Kalign is a command line tool to perform multiple alignment of biological sequences. It employs the Muth-Manber string-matching algorithm, to improve both the accuracy and speed of the alignment. It uses global, progressive alignment approach, enriched by employing an approximate string-matching algorithm to calculate sequence distances and by incorporating local matches into the otherwise global alignment.

Etiketler: Biyoloji: Clustal/ALN, Proteinler, Alan: field::biology, field::biology:bioinformatics, Geliştirildiği dil: implemented-in::c, interface::commandline, Rol: Program, Kapsam: Yardımcı Araç, Amaç: use::comparing, works-with-format::plaintext, Şununla çalışır: Ek etiket gerektiriyor

kalign ile İlgili Diğer Paketler

• dep: libc6 (>= 2.34) [alpha, ia64, loong64, sh4 değil]

  GNU C Library: Shared libraries
  ayrıca şunun tarafından sağlanan bir sanal paket libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.40) [loong64, sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

  GNU C Library: Shared libraries
  ayrıca şunun tarafından sağlanan bir sanal paket libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

• dep: libgomp1 (>= 4.9)

  GCC OpenMP (GOMP) support library

• enh: bioperl-run

  BioPerl wrappers: scripts

• enh: t-coffee

  Multiple Sequence Alignment

kalign indir

Tüm mevcut mimariler için indir

Mimari	Sürüm	Paket Boyutu	Kurulu Boyut	Dosyalar
alpha (resmi olmayan port)	1:3.4.0-1+b2	85,7 kB	409,0 kB	[dosya listesi]
amd64	1:3.4.0-1+b3	134,6 kB	1.127,0 kB	[dosya listesi]
arm64	1:3.4.0-1+b3	87,0 kB	407,0 kB	[dosya listesi]
armel	1:3.4.0-1+b3	80,1 kB	405,0 kB	[dosya listesi]
armhf	1:3.4.0-1+b3	77,6 kB	277,0 kB	[dosya listesi]
hppa (resmi olmayan port)	1:3.4.0-1+b2	83,4 kB	324,0 kB	[dosya listesi]
i386	1:3.4.0-1+b3	88,8 kB	341,0 kB	[dosya listesi]
ia64 (resmi olmayan port)	1:3.4.0-1	105,1 kB	557,0 kB	[dosya listesi]
loong64 (resmi olmayan port)	1:3.4.0-1+b2	95,7 kB	407,0 kB	[dosya listesi]
m68k (resmi olmayan port)	1:3.4.0-1+b2	80,6 kB	293,0 kB	[dosya listesi]
mips64el	1:3.4.0-1+b3	84,1 kB	421,0 kB	[dosya listesi]
ppc64 (resmi olmayan port)	1:3.4.0-1+b2	92,3 kB	471,0 kB	[dosya listesi]
ppc64el	1:3.4.0-1+b3	99,9 kB	471,0 kB	[dosya listesi]
riscv64	1:3.4.0-1+b3	88,2 kB	287,0 kB	[dosya listesi]
s390x	1:3.4.0-1+b3	96,4 kB	371,0 kB	[dosya listesi]
sh4 (resmi olmayan port)	1:3.4.0-1+b2	88,8 kB	277,0 kB	[dosya listesi]
sparc64 (resmi olmayan port)	1:3.4.0-1+b2	75,2 kB	2.138,0 kB	[dosya listesi]
x32 (resmi olmayan port)	1:3.4.0-1+b2	90,2 kB	329,0 kB	[dosya listesi]