Package: macs (3.0.2-1 and others)

[ Source: macs  ]

analisi basata su modelli di ChIP-Seq su sequenziatori di letture corte

MACS modella in modo empirico la lunghezza dei frammenti ChIP sequenziati, che tende ad essere più corta delle stime di dimensione per sonicazione o costruzione di biblioteche genomiche, e la usa per migliorare la risoluzione spaziale dei siti di legame predetti. MACS usa anche una distribuzione di Poisson dinamica per catturare in modo efficace i bias locali nella sequenza del genoma, permettendo una predizione più sensibile e robusta. MACS si comporta bene al confronto degli algoritmi esistenti ChIP-Seq di ricerca di picchi, è disponibile pubblicamente come open source e può essere usato per ChIP-Seq con o senza campioni di controllo.

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Architecture	Version	Package Size	Installed Size	Files
alpha (unofficial port)	3.0.2-1+b3	2,823.8 kB	9,248.0 kB	[list of files]
amd64	3.0.2-1+b3	3,047.7 kB	8,250.0 kB	[list of files]
arm64	3.0.2-1+b3	2,788.5 kB	8,056.0 kB	[list of files]
armel	3.0.2-1+b3	2,800.3 kB	8,452.0 kB	[list of files]
armhf	3.0.2-1+b3	2,858.6 kB	6,788.0 kB	[list of files]
hppa (unofficial port)	3.0.2-1+b3	2,858.6 kB	8,823.0 kB	[list of files]
i386	3.0.2-1+b3	3,008.0 kB	8,708.0 kB	[list of files]
ia64 (unofficial port)	2.2.6-3+b1	2,653.4 kB	11,172.0 kB	[list of files]
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riscv64	3.0.2-1+b3	3,062.1 kB	6,644.0 kB	[list of files]
s390x	3.0.2-1+b3	2,873.7 kB	8,082.0 kB	[list of files]
sh4 (unofficial port)	3.0.2-1+b1	4,294.4 kB	13,553.0 kB	[list of files]
sparc64 (unofficial port)	2.2.9.1-1+b1	2,977.6 kB	28,654.0 kB	[list of files]
x32 (unofficial port)	2.2.9.1-1	2,527.6 kB	5,365.0 kB	[list of files]