Package: macs (3.0.2-1 and others)

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analisi basata su modelli di ChIP-Seq su sequenziatori di letture corte

MACS modella in modo empirico la lunghezza dei frammenti ChIP sequenziati, che tende ad essere più corta delle stime di dimensione per sonicazione o costruzione di biblioteche genomiche, e la usa per migliorare la risoluzione spaziale dei siti di legame predetti. MACS usa anche una distribuzione di Poisson dinamica per catturare in modo efficace i bias locali nella sequenza del genoma, permettendo una predizione più sensibile e robusta. MACS si comporta bene al confronto degli algoritmi esistenti ChIP-Seq di ricerca di picchi, è disponibile pubblicamente come open source e può essere usato per ChIP-Seq con o senza campioni di controllo.

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dep: libc6 (>= 2.40) [sh4]
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Download for all available architectures
Architecture	Version	Package Size	Installed Size	Files
alpha (unofficial port)	3.0.2-1+b1	3,633.6 kB	17,043.0 kB	[list of files]
amd64	3.0.2-1+b1	3,990.6 kB	14,831.0 kB	[list of files]
arm64	3.0.2-1+b1	3,517.2 kB	14,531.0 kB	[list of files]
armel	3.0.2-1+b1	3,525.7 kB	13,491.0 kB	[list of files]
armhf	3.0.2-1+b1	3,606.7 kB	10,295.0 kB	[list of files]
hppa (unofficial port)	3.0.2-1+b1	3,632.5 kB	16,078.0 kB	[list of files]
i386	3.0.2-1+b1	3,884.0 kB	15,915.0 kB	[list of files]
ia64 (unofficial port)	2.2.6-3+b1	2,653.4 kB	11,172.0 kB	[list of files]
m68k (unofficial port)	3.0.2-1	3,389.2 kB	12,726.0 kB	[list of files]
ppc64 (unofficial port)	3.0.2-1+b1	3,652.8 kB	18,757.0 kB	[list of files]
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sh4 (unofficial port)	3.0.2-1+b1	4,294.4 kB	13,553.0 kB	[list of files]
sparc64 (unofficial port)	2.2.9.1-1+b1	2,977.6 kB	28,654.0 kB	[list of files]
x32 (unofficial port)	2.2.9.1-1	2,527.6 kB	5,365.0 kB	[list of files]