Пакет: macs (3.0.2-1 и другие)

[ Источник: macs  ]

Model-based Analysis of ChIP-Seq on short reads sequencers

MACS empirically models the length of the sequenced ChIP fragments, which tends to be shorter than sonication or library construction size estimates, and uses it to improve the spatial resolution of predicted binding sites. MACS also uses a dynamic Poisson distribution to effectively capture local biases in the genome sequence, allowing for more sensitive and robust prediction. MACS compares favorably to existing ChIP-Seq peak-finding algorithms, is publicly available open source, and can be used for ChIP-Seq with or without control samples.

Другие пакеты, относящиеся к macs

• dep: cython3 [x32]

  C-Extensions for Python 3

• dep: cython3-legacy [sparc64]

  C-Extensions for Python 3 (legacy version 0.29)

• dep: libc6 (>= 2.29) [sparc64, x32]

  библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
  также виртуальный пакет, предоставляемый libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.38) [не alpha, ia64, sh4, sparc64, x32]

  dep: libc6 (>= 2.40) [sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.30) [ia64]

  библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
  также виртуальный пакет, предоставляемый libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.38) [alpha]

• dep: python3

  интерактивный высокоуровневый объектно-ориентированный язык (версия python3 по умолчанию)

  dep: python3 (<< 3.12) [x32]

  dep: python3 (<< 3.13) [sparc64]

  dep: python3 (<< 3.14) [не ia64, sparc64, x32]

  dep: python3 (<< 3.9) [ia64]

  dep: python3 (>= 3.11~) [sparc64, x32]

  dep: python3 (>= 3.12~) [не ia64, sparc64, x32]

  dep: python3 (>= 3.8~) [ia64]

• dep: python3-cykhash [не ia64, sparc64, x32]

  cython wrapper for khash-sets/maps, efficient implementation of isin and unique

• dep: python3-hmmlearn [не ia64, sparc64, x32]

  unsupervised learning and inference of Hidden Markov Models

• dep: python3-numpy [ia64, sparc64, x32]

  Fast array facility to the Python language (Python 3)

  dep: python3-numpy (>= 1:1.25.0) [не ia64, sparc64, x32]

• dep: python3-numpy-abi9 [не ia64, sparc64, x32]

  виртуальный пакет, предоставляемый python3-numpy

• dep: python3-scipy [не ia64, sparc64, x32]

  scientific tools for Python 3

• dep: python3-sklearn [не ia64, sparc64, x32]

  Python modules for machine learning and data mining - Python 3

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4) [alpha, amd64, arm64, i386, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x]

  библиотека сжатия

  dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.3) [armel, armhf, hppa, m68k, sh4]

Загрузка macs

Загрузить для всех доступных архитектур

Архитектура	Версия	Размер пакета	В установленном виде	Файлы
alpha (неофициальный перенос)	3.0.2-1+b1	3 633,6 Кб	17 043,0 Кб	[список файлов]
amd64	3.0.2-1+b1	3 990,6 Кб	14 831,0 Кб	[список файлов]
arm64	3.0.2-1+b1	3 517,2 Кб	14 531,0 Кб	[список файлов]
armel	3.0.2-1+b1	3 525,7 Кб	13 491,0 Кб	[список файлов]
armhf	3.0.2-1+b1	3 606,7 Кб	10 295,0 Кб	[список файлов]
hppa (неофициальный перенос)	3.0.2-1+b1	3 632,5 Кб	16 078,0 Кб	[список файлов]
i386	3.0.2-1+b1	3 884,0 Кб	15 915,0 Кб	[список файлов]
ia64 (неофициальный перенос)	2.2.6-3+b1	2 653,4 Кб	11 172,0 Кб	[список файлов]
m68k (неофициальный перенос)	3.0.2-1	3 389,2 Кб	12 726,0 Кб	[список файлов]
ppc64 (неофициальный перенос)	3.0.2-1+b1	3 652,8 Кб	18 757,0 Кб	[список файлов]
ppc64el	3.0.2-1+b1	3 715,8 Кб	18 115,0 Кб	[список файлов]
riscv64	3.0.2-1+b1	3 978,8 Кб	11 515,0 Кб	[список файлов]
s390x	3.0.2-1+b1	3 756,2 Кб	14 927,0 Кб	[список файлов]
sh4 (неофициальный перенос)	3.0.2-1+b1	4 294,4 Кб	13 553,0 Кб	[список файлов]
sparc64 (неофициальный перенос)	2.2.9.1-1+b1	2 977,6 Кб	28 654,0 Кб	[список файлов]
x32 (неофициальный перенос)	2.2.9.1-1	2 527,6 Кб	5 365,0 Кб	[список файлов]