Package: macs (3.0.2-1 and others)

[ Source: macs  ]

analisi basata su modelli di ChIP-Seq su sequenziatori di letture corte

MACS modella in modo empirico la lunghezza dei frammenti ChIP sequenziati, che tende ad essere più corta delle stime di dimensione per sonicazione o costruzione di biblioteche genomiche, e la usa per migliorare la risoluzione spaziale dei siti di legame predetti. MACS usa anche una distribuzione di Poisson dinamica per catturare in modo efficace i bias locali nella sequenza del genoma, permettendo una predizione più sensibile e robusta. MACS si comporta bene al confronto degli algoritmi esistenti ChIP-Seq di ricerca di picchi, è disponibile pubblicamente come open source e può essere usato per ChIP-Seq con o senza campioni di controllo.

Other Packages Related to macs

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Architecture	Version	Package Size	Installed Size	Files
amd64	3.0.2-1+b1	3,990.6 kB	14,831.0 kB	[list of files]
arm64	3.0.2-1+b1	3,517.2 kB	14,531.0 kB	[list of files]
armel	3.0.2-1+b1	3,525.7 kB	13,491.0 kB	[list of files]
armhf	3.0.2-1+b1	3,606.7 kB	10,295.0 kB	[list of files]
i386	3.0.2-1+b1	3,884.0 kB	15,915.0 kB	[list of files]
ppc64el	3.0.2-1+b1	3,715.8 kB	18,115.0 kB	[list of files]
riscv64	3.0.2-1+b1	3,978.8 kB	11,515.0 kB	[list of files]
s390x	3.0.2-1+b1	3,756.2 kB	14,927.0 kB	[list of files]