Paket: macs (3.0.2-1 und andere)

[ Quellcode: macs  ]

Model-based Analysis of ChIP-Seq on short reads sequencers

MACS empirically models the length of the sequenced ChIP fragments, which tends to be shorter than sonication or library construction size estimates, and uses it to improve the spatial resolution of predicted binding sites. MACS also uses a dynamic Poisson distribution to effectively capture local biases in the genome sequence, allowing for more sensitive and robust prediction. MACS compares favorably to existing ChIP-Seq peak-finding algorithms, is publicly available open source, and can be used for ChIP-Seq with or without control samples.

Andere Pakete mit Bezug zu macs

• dep: cython3 [x32]

  C-Extensions for Python 3

• dep: cython3-legacy [sparc64]

  C-Extensions for Python 3 (legacy version 0.29)

• dep: libc6 (>= 2.29) [sparc64, x32]

  GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
  auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.38) [nicht alpha, ia64, sh4, sparc64, x32]

  dep: libc6 (>= 2.40) [sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.30) [ia64]

  GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
  auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.38) [alpha]

• dep: python3

  interactive high-level object-oriented language (default python3 version)

  dep: python3 (<< 3.12) [x32]

  dep: python3 (<< 3.13) [sparc64]

  dep: python3 (<< 3.14) [nicht ia64, sparc64, x32]

  dep: python3 (<< 3.9) [ia64]

  dep: python3 (>= 3.11~) [sparc64, x32]

  dep: python3 (>= 3.12~) [m68k, sh4]

  dep: python3 (>= 3.13~) [nicht ia64, m68k, sh4, sparc64, x32]

  dep: python3 (>= 3.8~) [ia64]

• dep: python3-cykhash [nicht ia64, sparc64, x32]

  cython wrapper for khash-sets/maps, efficient implementation of isin and unique

• dep: python3-hmmlearn [nicht ia64, sparc64, x32]

  unsupervised learning and inference of Hidden Markov Models

• dep: python3-numpy [nicht m68k, sh4]

  Python library for numerical computations (Python 3)

  dep: python3-numpy (>= 1:1.25.0) [m68k, sh4]

• dep: python3-numpy-abi9 [m68k, sh4]

  virtuelles Paket, bereitgestellt durch python3-numpy

• dep: python3-numpy2-abi0 [nicht ia64, m68k, sh4, sparc64, x32]

  virtuelles Paket, bereitgestellt durch python3-numpy

  oder python3-numpy-abi9

  virtuelles Paket, bereitgestellt durch python3-numpy

• dep: python3-scipy [nicht ia64, sparc64, x32]

  Wissenschaftliche Werkzeuge für Python 3

• dep: python3-sklearn [nicht ia64, sparc64, x32]

  Python modules for machine learning and data mining - Python 3

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4) [alpha, amd64, arm64, i386, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x]

  Kompressions-Bibliothek - Laufzeit

  dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.3) [armel, armhf, hppa, m68k, sh4]

macs herunterladen

Download für alle verfügbaren Architekturen

Architektur	Version	Paketgröße	Größe (installiert)	Dateien
alpha (inoffizielle Portierung)	3.0.2-1+b3	2.823,8 kB	9.248,0 kB	[Liste der Dateien]
amd64	3.0.2-1+b3	3.047,7 kB	8.250,0 kB	[Liste der Dateien]
arm64	3.0.2-1+b3	2.788,5 kB	8.056,0 kB	[Liste der Dateien]
armel	3.0.2-1+b3	2.800,3 kB	8.452,0 kB	[Liste der Dateien]
armhf	3.0.2-1+b3	2.858,6 kB	6.788,0 kB	[Liste der Dateien]
hppa (inoffizielle Portierung)	3.0.2-1+b3	2.858,6 kB	8.823,0 kB	[Liste der Dateien]
i386	3.0.2-1+b3	3.008,0 kB	8.708,0 kB	[Liste der Dateien]
ia64 (inoffizielle Portierung)	2.2.6-3+b1	2.653,4 kB	11.172,0 kB	[Liste der Dateien]
m68k (inoffizielle Portierung)	3.0.2-1	3.389,2 kB	12.726,0 kB	[Liste der Dateien]
ppc64 (inoffizielle Portierung)	3.0.2-1+b3	2.888,4 kB	10.233,0 kB	[Liste der Dateien]
ppc64el	3.0.2-1+b3	2.929,5 kB	9.720,0 kB	[Liste der Dateien]
riscv64	3.0.2-1+b3	3.062,1 kB	6.644,0 kB	[Liste der Dateien]
s390x	3.0.2-1+b3	2.873,7 kB	8.082,0 kB	[Liste der Dateien]
sh4 (inoffizielle Portierung)	3.0.2-1+b1	4.294,4 kB	13.553,0 kB	[Liste der Dateien]
sparc64 (inoffizielle Portierung)	2.2.9.1-1+b1	2.977,6 kB	28.654,0 kB	[Liste der Dateien]
x32 (inoffizielle Portierung)	2.2.9.1-1	2.527,6 kB	5.365,0 kB	[Liste der Dateien]