Package: macs (2.1.2.1-1)

[ Source: macs  ]

analisi basata su modelli di ChIP-Seq su sequenziatori di letture corte

MACS modella in modo empirico la lunghezza dei frammenti ChIP sequenziati, che tende ad essere più corta delle stime di dimensione per sonicazione o costruzione di biblioteche genomiche, e la usa per migliorare la risoluzione spaziale dei siti di legame predetti. MACS usa anche una distribuzione di Poisson dinamica per catturare in modo efficace i bias locali nella sequenza del genoma, permettendo una predizione più sensibile e robusta. MACS si comporta bene al confronto degli algoritmi esistenti ChIP-Seq di ricerca di picchi, è disponibile pubblicamente come open source e può essere usato per ChIP-Seq con o senza campioni di controllo.

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Architecture	Package Size	Installed Size	Files
amd64	2,397.2 kB	5,551.0 kB	[list of files]
arm64	2,163.6 kB	5,281.0 kB	[list of files]
armhf	2,307.4 kB	4,225.0 kB	[list of files]
i386	2,231.7 kB	5,714.0 kB	[list of files]