Package: macs (2.2.7.1-3 and others)

[ Source: macs  ]

analisi basata su modelli di ChIP-Seq su sequenziatori di letture corte

MACS modella in modo empirico la lunghezza dei frammenti ChIP sequenziati, che tende ad essere più corta delle stime di dimensione per sonicazione o costruzione di biblioteche genomiche, e la usa per migliorare la risoluzione spaziale dei siti di legame predetti. MACS usa anche una distribuzione di Poisson dinamica per catturare in modo efficace i bias locali nella sequenza del genoma, permettendo una predizione più sensibile e robusta. MACS si comporta bene al confronto degli algoritmi esistenti ChIP-Seq di ricerca di picchi, è disponibile pubblicamente come open source e può essere usato per ChIP-Seq con o senza campioni di controllo.

Other Packages Related to macs

• dep: libc6 (>= 2.29) [not i386]

  Libreria C GNU: librerie condivise
  also a virtual package provided by libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.4) [i386]

• dep: python3

  linguaggio interattivo di alto livello orientato agli oggetti (versione python3 predefinita)

  dep: python3 (<< 3.10)

  dep: python3 (>= 3.9~)

• dep: python3-numpy

  veloce struttura per array per il linguaggio Python 3

Download macs

Download for all available architectures

Architecture	Version	Package Size	Installed Size	Files
amd64	2.2.7.1-3+b2	2,457.8 kB	5,651.0 kB	[list of files]
arm64	2.2.7.1-3+b2	2,297.1 kB	5,236.0 kB	[list of files]
armel	2.2.7.1-3+b2	2,301.4 kB	5,294.0 kB	[list of files]
armhf	2.2.7.1-3+b2	2,340.8 kB	4,170.0 kB	[list of files]
i386	2.2.7.1-3+b2	2,450.1 kB	6,042.0 kB	[list of files]
ppc64el	2.2.7.1-3+b2	2,386.1 kB	6,604.0 kB	[list of files]
s390x	2.2.7.1-3+b2	2,249.0 kB	5,643.0 kB	[list of files]