[ ソース: macs ]
パッケージ: macs (3.0.2-1 など)
Model-based Analysis of ChIP-Seq on short reads sequencers
MACS empirically models the length of the sequenced ChIP fragments, which tends to be shorter than sonication or library construction size estimates, and uses it to improve the spatial resolution of predicted binding sites. MACS also uses a dynamic Poisson distribution to effectively capture local biases in the genome sequence, allowing for more sensitive and robust prediction. MACS compares favorably to existing ChIP-Seq peak-finding algorithms, is publicly available open source, and can be used for ChIP-Seq with or without control samples.
その他の macs 関連パッケージ
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- dep: cython3 [x32]
- C-Extensions for Python 3
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- dep: cython3-legacy [sparc64]
- C-Extensions for Python 3 (legacy version 0.29)
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- dep: libc6 (>= 2.29) [sparc64, x32]
- GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb
- dep: libc6 (>= 2.38) [alpha, ia64, sh4, sparc64, x32 以外]
- dep: libc6 (>= 2.40) [sh4]
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- dep: libc6.1 (>= 2.30) [ia64]
- GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6.1-udeb
- dep: libc6.1 (>= 2.38) [alpha]
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- dep: python3
- interactive high-level object-oriented language (default python3 version)
- dep: python3 (<< 3.12) [x32]
- dep: python3 (<< 3.13) [sparc64]
- dep: python3 (<< 3.14) [ia64, sparc64, x32 以外]
- dep: python3 (<< 3.9) [ia64]
- dep: python3 (>= 3.11~) [sparc64, x32]
- dep: python3 (>= 3.12~) [m68k, sh4]
- dep: python3 (>= 3.13~) [ia64, m68k, sh4, sparc64, x32 以外]
- dep: python3 (>= 3.8~) [ia64]
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- dep: python3-cykhash [ia64, sparc64, x32 以外]
- cython wrapper for khash-sets/maps, efficient implementation of isin and unique
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- dep: python3-hmmlearn [ia64, sparc64, x32 以外]
- unsupervised learning and inference of Hidden Markov Models
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- dep: python3-numpy [m68k, sh4 以外]
- Python library for numerical computations (Python 3)
- dep: python3-numpy (>= 1:1.25.0) [m68k, sh4]
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- dep: python3-numpy-abi9 [m68k, sh4]
- 以下のパッケージによって提供される仮想パッケージです: python3-numpy
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- dep: python3-numpy2-abi0 [ia64, m68k, sh4, sparc64, x32 以外]
- 以下のパッケージによって提供される仮想パッケージです: python3-numpy
- または python3-numpy-abi9
- 以下のパッケージによって提供される仮想パッケージです: python3-numpy
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- dep: python3-scipy [ia64, sparc64, x32 以外]
- scientific tools for Python 3
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- dep: python3-sklearn [ia64, sparc64, x32 以外]
- Python modules for machine learning and data mining - Python 3
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- dep: zlib1g (>= 1:1.1.4) [alpha, amd64, arm64, i386, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x]
- 圧縮ライブラリ - ランタイム
- dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.3) [armel, armhf, hppa, m68k, sh4]
macs のダウンロード
| アーキテクチャ | バージョン | パッケージサイズ | インストールサイズ | ファイル |
|---|---|---|---|---|
| alpha (非公式の移植版) | 3.0.2-1+b3 | 2,823.8 kB | 9,248.0 kB | [ファイル一覧] |
| amd64 | 3.0.2-1+b3 | 3,047.7 kB | 8,250.0 kB | [ファイル一覧] |
| arm64 | 3.0.2-1+b3 | 2,788.5 kB | 8,056.0 kB | [ファイル一覧] |
| armel | 3.0.2-1+b3 | 2,800.3 kB | 8,452.0 kB | [ファイル一覧] |
| armhf | 3.0.2-1+b3 | 2,858.6 kB | 6,788.0 kB | [ファイル一覧] |
| hppa (非公式の移植版) | 3.0.2-1+b3 | 2,858.6 kB | 8,823.0 kB | [ファイル一覧] |
| i386 | 3.0.2-1+b3 | 3,008.0 kB | 8,708.0 kB | [ファイル一覧] |
| ia64 (非公式の移植版) | 2.2.6-3+b1 | 2,653.4 kB | 11,172.0 kB | [ファイル一覧] |
| m68k (非公式の移植版) | 3.0.2-1 | 3,389.2 kB | 12,726.0 kB | [ファイル一覧] |
| ppc64 (非公式の移植版) | 3.0.2-1+b3 | 2,888.4 kB | 10,233.0 kB | [ファイル一覧] |
| ppc64el | 3.0.2-1+b3 | 2,929.5 kB | 9,720.0 kB | [ファイル一覧] |
| riscv64 | 3.0.2-1+b3 | 3,062.1 kB | 6,644.0 kB | [ファイル一覧] |
| s390x | 3.0.2-1+b3 | 2,873.7 kB | 8,082.0 kB | [ファイル一覧] |
| sh4 (非公式の移植版) | 3.0.2-1+b1 | 4,294.4 kB | 13,553.0 kB | [ファイル一覧] |
| sparc64 (非公式の移植版) | 2.2.9.1-1+b1 | 2,977.6 kB | 28,654.0 kB | [ファイル一覧] |
| x32 (非公式の移植版) | 2.2.9.1-1 | 2,527.6 kB | 5,365.0 kB | [ファイル一覧] |