Pakiet: macs (3.0.2-1 i inne)

[ Pakiet źródłowy: macs  ]

Model-based Analysis of ChIP-Seq on short reads sequencers

MACS empirically models the length of the sequenced ChIP fragments, which tends to be shorter than sonication or library construction size estimates, and uses it to improve the spatial resolution of predicted binding sites. MACS also uses a dynamic Poisson distribution to effectively capture local biases in the genome sequence, allowing for more sensitive and robust prediction. MACS compares favorably to existing ChIP-Seq peak-finding algorithms, is publicly available open source, and can be used for ChIP-Seq with or without control samples.

Inne pakiety związane z macs

• dep: cython3 [x32]

  C-Extensions for Python 3

• dep: cython3-legacy [sparc64]

  C-Extensions for Python 3 (legacy version 0.29)

• dep: libc6 (>= 2.29) [sparc64, x32]

  Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
  również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.38) [nie alpha, ia64, sh4, sparc64, x32]

  dep: libc6 (>= 2.40) [sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.30) [ia64]

  Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
  również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.38) [alpha]

• dep: python3

  Interaktywny, wysokopoziomowy i obiektowy język programowania (domyślna wersja Python 3)

  dep: python3 (<< 3.12) [x32]

  dep: python3 (<< 3.13) [sparc64]

  dep: python3 (<< 3.14) [nie ia64, sparc64, x32]

  dep: python3 (<< 3.9) [ia64]

  dep: python3 (>= 3.11~) [sparc64, x32]

  dep: python3 (>= 3.12~) [m68k, sh4]

  dep: python3 (>= 3.13~) [nie ia64, m68k, sh4, sparc64, x32]

  dep: python3 (>= 3.8~) [ia64]

• dep: python3-cykhash [nie ia64, sparc64, x32]

  cython wrapper for khash-sets/maps, efficient implementation of isin and unique

• dep: python3-hmmlearn [nie ia64, sparc64, x32]

  unsupervised learning and inference of Hidden Markov Models

• dep: python3-numpy [nie m68k, sh4]

  Biblioteka Pythona do obliczeń numerycznych (Python 3)

  dep: python3-numpy (>= 1:1.25.0) [m68k, sh4]

• dep: python3-numpy-abi9 [m68k, sh4]

  pakiet wirtualny udostępniany przez python3-numpy

• dep: python3-numpy2-abi0 [nie ia64, m68k, sh4, sparc64, x32]

  pakiet wirtualny udostępniany przez python3-numpy

  lub python3-numpy-abi9

  pakiet wirtualny udostępniany przez python3-numpy

• dep: python3-scipy [nie ia64, sparc64, x32]

  Narzędzia naukowe dla Pythona 3

• dep: python3-sklearn [nie ia64, sparc64, x32]

  Python modules for machine learning and data mining - Python 3

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4) [alpha, amd64, arm64, i386, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x]

  Biblioteka kompresyjna - pliki wykonawcze

  dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.3) [armel, armhf, hppa, m68k, sh4]

Pobieranie macs

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur

Architektura	Wersja	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
alpha (port nieoficjalny)	3.0.2-1+b3	2 823,8 KiB	9 248,0 KiB	[lista plików]
amd64	3.0.2-1+b3	3 047,7 KiB	8 250,0 KiB	[lista plików]
arm64	3.0.2-1+b3	2 788,5 KiB	8 056,0 KiB	[lista plików]
armel	3.0.2-1+b3	2 800,3 KiB	8 452,0 KiB	[lista plików]
armhf	3.0.2-1+b3	2 858,6 KiB	6 788,0 KiB	[lista plików]
hppa (port nieoficjalny)	3.0.2-1+b3	2 858,6 KiB	8 823,0 KiB	[lista plików]
i386	3.0.2-1+b3	3 008,0 KiB	8 708,0 KiB	[lista plików]
ia64 (port nieoficjalny)	2.2.6-3+b1	2 653,4 KiB	11 172,0 KiB	[lista plików]
m68k (port nieoficjalny)	3.0.2-1	3 389,2 KiB	12 726,0 KiB	[lista plików]
ppc64 (port nieoficjalny)	3.0.2-1+b3	2 888,4 KiB	10 233,0 KiB	[lista plików]
ppc64el	3.0.2-1+b3	2 929,5 KiB	9 720,0 KiB	[lista plików]
riscv64	3.0.2-1+b3	3 062,1 KiB	6 644,0 KiB	[lista plików]
s390x	3.0.2-1+b3	2 873,7 KiB	8 082,0 KiB	[lista plików]
sh4 (port nieoficjalny)	3.0.2-1+b1	4 294,4 KiB	13 553,0 KiB	[lista plików]
sparc64 (port nieoficjalny)	2.2.9.1-1+b1	2 977,6 KiB	28 654,0 KiB	[lista plików]
x32 (port nieoficjalny)	2.2.9.1-1	2 527,6 KiB	5 365,0 KiB	[lista plików]