Paket: macs (3.0.2-1 ve diğerleri)

[ Kaynak: macs  ]

Model-based Analysis of ChIP-Seq on short reads sequencers

MACS empirically models the length of the sequenced ChIP fragments, which tends to be shorter than sonication or library construction size estimates, and uses it to improve the spatial resolution of predicted binding sites. MACS also uses a dynamic Poisson distribution to effectively capture local biases in the genome sequence, allowing for more sensitive and robust prediction. MACS compares favorably to existing ChIP-Seq peak-finding algorithms, is publicly available open source, and can be used for ChIP-Seq with or without control samples.

macs ile İlgili Diğer Paketler

• dep: cython3 [x32]

  C-Extensions for Python 3

• dep: cython3-legacy [sparc64]

  C-Extensions for Python 3 (legacy version 0.29)

• dep: libc6 (>= 2.29) [sparc64, x32]

  GNU C Library: Shared libraries
  ayrıca şunun tarafından sağlanan bir sanal paket libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.38) [alpha, ia64, sh4, sparc64, x32 değil]

  dep: libc6 (>= 2.40) [sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.30) [ia64]

  GNU C Library: Shared libraries
  ayrıca şunun tarafından sağlanan bir sanal paket libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.38) [alpha]

• dep: python3

  interactive high-level object-oriented language (default python3 version)

  dep: python3 (<< 3.12) [x32]

  dep: python3 (<< 3.13) [sparc64]

  dep: python3 (<< 3.14) [ia64, sparc64, x32 değil]

  dep: python3 (<< 3.9) [ia64]

  dep: python3 (>= 3.11~) [sparc64, x32]

  dep: python3 (>= 3.12~) [ia64, sparc64, x32 değil]

  dep: python3 (>= 3.8~) [ia64]

• dep: python3-cykhash [ia64, sparc64, x32 değil]

  cython wrapper for khash-sets/maps, efficient implementation of isin and unique

• dep: python3-hmmlearn [ia64, sparc64, x32 değil]

  unsupervised learning and inference of Hidden Markov Models

• dep: python3-numpy [ia64, sparc64, x32]

  Fast array facility to the Python language (Python 3)

  dep: python3-numpy (>= 1:1.25.0) [ia64, sparc64, x32 değil]

• dep: python3-numpy-abi9 [ia64, sparc64, x32 değil]

  sanal paketi sağlayan python3-numpy

• dep: python3-scipy [ia64, sparc64, x32 değil]

  scientific tools for Python 3

• dep: python3-sklearn [ia64, sparc64, x32 değil]

  Python modules for machine learning and data mining - Python 3

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4) [alpha, amd64, arm64, i386, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x]

  compression library - runtime

  dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.3) [armel, armhf, hppa, m68k, sh4]

macs indir

Tüm mevcut mimariler için indir

Mimari	Sürüm	Paket Boyutu	Kurulu Boyut	Dosyalar
alpha (resmi olmayan port)	3.0.2-1+b1	3.633,6 kB	17.043,0 kB	[dosya listesi]
amd64	3.0.2-1+b1	3.990,6 kB	14.831,0 kB	[dosya listesi]
arm64	3.0.2-1+b1	3.517,2 kB	14.531,0 kB	[dosya listesi]
armel	3.0.2-1+b1	3.525,7 kB	13.491,0 kB	[dosya listesi]
armhf	3.0.2-1+b1	3.606,7 kB	10.295,0 kB	[dosya listesi]
hppa (resmi olmayan port)	3.0.2-1+b1	3.632,5 kB	16.078,0 kB	[dosya listesi]
i386	3.0.2-1+b1	3.884,0 kB	15.915,0 kB	[dosya listesi]
ia64 (resmi olmayan port)	2.2.6-3+b1	2.653,4 kB	11.172,0 kB	[dosya listesi]
m68k (resmi olmayan port)	3.0.2-1	3.389,2 kB	12.726,0 kB	[dosya listesi]
ppc64 (resmi olmayan port)	3.0.2-1+b1	3.652,8 kB	18.757,0 kB	[dosya listesi]
ppc64el	3.0.2-1+b1	3.715,8 kB	18.115,0 kB	[dosya listesi]
riscv64	3.0.2-1+b1	3.978,8 kB	11.515,0 kB	[dosya listesi]
s390x	3.0.2-1+b1	3.756,2 kB	14.927,0 kB	[dosya listesi]
sh4 (resmi olmayan port)	3.0.2-1+b1	4.294,4 kB	13.553,0 kB	[dosya listesi]
sparc64 (resmi olmayan port)	2.2.9.1-1+b1	2.977,6 kB	28.654,0 kB	[dosya listesi]
x32 (resmi olmayan port)	2.2.9.1-1	2.527,6 kB	5.365,0 kB	[dosya listesi]