Package: kissplice (2.6.7-1 and others)

[ Source: kissplice  ]

rilevamento di vari tipi di polimorfismi in dati RNA-Seq

KisSplice è un software che permette l'analisi di dati RNA-Seq con o senza un genoma di riferimento. È un assemblatore esatto di trascrittoma che permette di identificare SNP, indel e eventi di splicing alternativo. Può lavorare con un numero arbitrario di condizioni biologiche e quantifica ciascuna variante in ogni condizione. È stato provato su insiemi di dati Illumina con fino a 1G di letture. Il suo consumo di memoria è di circa 5Gb per 100M letture.

Other Packages Related to kissplice

• dep: bcalm [not alpha, hppa, m68k, sh4, x32]

  compattamento de Bruijn in poca memoria

• dep: libc6 (>= 2.11) [hppa]

  Libreria C GNU: librerie condivise
  also a virtual package provided by libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.17) [sh4]

  dep: libc6 (>= 2.29) [x32]

  dep: libc6 (>= 2.38) [amd64, arm64, mips64el, ppc64, ppc64el, riscv64, sparc64]

  dep: libc6 (>= 2.39) [loong64]

  dep: libc6 (>= 2.4) [m68k]

• dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

  Libreria C GNU: librerie condivise
  also a virtual package provided by libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.4) [alpha]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, arm64, loong64, mips64el, ppc64, ppc64el, x32]

  libreria di supporto a GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [sparc64]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.3) [riscv64]

• dep: libgcc1 (>= 1:4.1.1) [alpha]

  Package not available

  dep: libgcc1 (>= 1:4.2.1) [sh4]

• dep: libgcc2 (>= 4.2.1) [m68k]

  Package not available

• dep: libgcc4 (>= 4.1.1) [hppa]

  Package not available

• dep: libgomp1 (>= 4.9) [not alpha, hppa, m68k, sh4, x32]

  libreria di supporto GOMP (GCC OpenMP)

• dep: libstdc++6 (>= 13.1) [not alpha, hppa, m68k, sh4, x32]

  libreria GNU Standard C++, versione 3

  dep: libstdc++6 (>= 4.6) [hppa, sh4]

  dep: libstdc++6 (>= 4.9) [alpha, m68k]

  dep: libstdc++6 (>= 9) [x32]

• dep: libunwind8 [ia64]

  libreria per tracciare la catena di chiamate di un programma - runtime

• dep: python [alpha, hppa, m68k, sh4]

  Package not available

• dep: python3 [not alpha, hppa, m68k, sh4]

  linguaggio interattivo di alto livello orientato agli oggetti (versione python3 predefinita)

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4) [not alpha, hppa, m68k, sh4]

  libreria di compressione - runtime

  dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.4) [alpha, hppa, m68k, sh4]

Download kissplice

Download for all available architectures

Architecture	Version	Package Size	Installed Size	Files
alpha (unofficial port)	2.2.1-1	596.7 kB	1,376.0 kB	[list of files]
amd64	2.6.7-1	485.0 kB	1,178.0 kB	[list of files]
arm64	2.6.7-1	469.8 kB	1,370.0 kB	[list of files]
hppa (unofficial port)	2.1.0-1	1,289.9 kB	2,181.0 kB	[list of files]
ia64 (unofficial port)	2.6.2-3	506.4 kB	1,581.0 kB	[list of files]
loong64 (unofficial port)	2.6.7-1	469.7 kB	1,146.0 kB	[list of files]
m68k (unofficial port)	2.2.1-1	555.8 kB	1,120.0 kB	[list of files]
mips64el	2.6.7-1	486.1 kB	1,466.0 kB	[list of files]
ppc64 (unofficial port)	2.6.7-1	485.5 kB	1,434.0 kB	[list of files]
ppc64el	2.6.7-1	486.5 kB	1,434.0 kB	[list of files]
riscv64	2.6.7-1	480.3 kB	1,002.0 kB	[list of files]
sh4 (unofficial port)	2.1.0-1	1,282.1 kB	2,090.0 kB	[list of files]
sparc64 (unofficial port)	2.6.7-1	460.2 kB	7,783.0 kB	[list of files]
x32 (unofficial port)	2.5.3-1	4,035.5 kB	15,302.0 kB	[list of files]