Pakiet: kissplice (2.6.7-1 i inne)

[ Pakiet źródłowy: kissplice  ]

Detection of various kinds of polymorphisms in RNA-seq data

KisSplice is a piece of software that enables the analysis of RNA-seq data with or without a reference genome. It is an exact local transcriptome assembler that allows one to identify SNPs, indels and alternative splicing events. It can deal with an arbitrary number of biological conditions, and will quantify each variant in each condition. It has been tested on Illumina datasets of up to 1G reads. Its memory consumption is around 5Gb for 100M reads.

Inne pakiety związane z kissplice

• dep: bcalm [nie alpha, hppa, m68k, sh4, x32]

  Zagęszczanie de Bruijna przy małej ilości pamięci

• dep: libc6 (>= 2.11) [hppa]

  Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
  również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.17) [sh4]

  dep: libc6 (>= 2.29) [x32]

  dep: libc6 (>= 2.38) [nie alpha, hppa, ia64, m68k, sh4, x32]

  dep: libc6 (>= 2.4) [m68k]

• dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

  Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
  również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.4) [alpha]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, arm64, mips64el, ppc64, ppc64el, x32]

  Biblioteka wspomagająca GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [sparc64]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.3) [riscv64]

• dep: libgcc1 (>= 1:4.1.1) [alpha]

  Pakiet niedostępny

  dep: libgcc1 (>= 1:4.2.1) [sh4]

• dep: libgcc2 (>= 4.2.1) [m68k]

  Pakiet niedostępny

• dep: libgcc4 (>= 4.1.1) [hppa]

  Pakiet niedostępny

• dep: libgomp1 (>= 4.9) [nie alpha, hppa, m68k, sh4, x32]

  Biblioteka wspierająca GCC OpenMP (GOMP)

• dep: libstdc++6 (>= 13.1) [nie alpha, hppa, m68k, sh4, x32]

  Standardowa biblioteka GNU C++, wersja 3

  dep: libstdc++6 (>= 4.6) [hppa, sh4]

  dep: libstdc++6 (>= 4.9) [alpha, m68k]

  dep: libstdc++6 (>= 9) [x32]

• dep: libunwind8 [ia64]

  Biblioteka do ustalania łańcucha wywołań programu - środowisko uruchomieniowe

• dep: python [alpha, hppa, m68k, sh4]

  Pakiet niedostępny

• dep: python3 [nie alpha, hppa, m68k, sh4]

  Interaktywny, wysokopoziomowy i obiektowy język programowania (domyślna wersja Python 3)

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4) [nie alpha, hppa, m68k, sh4]

  Biblioteka kompresyjna - pliki wykonawcze

  dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.4) [alpha, hppa, m68k, sh4]

Pobieranie kissplice

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur

Architektura	Wersja	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
alpha (port nieoficjalny)	2.2.1-1	596,7 KiB	1 376,0 KiB	[lista plików]
amd64	2.6.7-1	485,0 KiB	1 178,0 KiB	[lista plików]
arm64	2.6.7-1	469,8 KiB	1 370,0 KiB	[lista plików]
hppa (port nieoficjalny)	2.1.0-1	1 289,9 KiB	2 181,0 KiB	[lista plików]
ia64 (port nieoficjalny)	2.6.2-3	506,4 KiB	1 581,0 KiB	[lista plików]
m68k (port nieoficjalny)	2.2.1-1	555,8 KiB	1 120,0 KiB	[lista plików]
mips64el	2.6.7-1	486,1 KiB	1 466,0 KiB	[lista plików]
ppc64 (port nieoficjalny)	2.6.7-1	485,5 KiB	1 434,0 KiB	[lista plików]
ppc64el	2.6.7-1	486,5 KiB	1 434,0 KiB	[lista plików]
riscv64	2.6.7-1	480,3 KiB	1 002,0 KiB	[lista plików]
sh4 (port nieoficjalny)	2.1.0-1	1 282,1 KiB	2 090,0 KiB	[lista plików]
sparc64 (port nieoficjalny)	2.6.7-1	460,2 KiB	7 783,0 KiB	[lista plików]
x32 (port nieoficjalny)	2.5.3-1	4 035,5 KiB	15 302,0 KiB	[lista plików]