软件包：kissplice（2.6.7-1 以及其他的）

[ 源代码： kissplice  ]

Detection of various kinds of polymorphisms in RNA-seq data

KisSplice is a piece of software that enables the analysis of RNA-seq data with or without a reference genome. It is an exact local transcriptome assembler that allows one to identify SNPs, indels and alternative splicing events. It can deal with an arbitrary number of biological conditions, and will quantify each variant in each condition. It has been tested on Illumina datasets of up to 1G reads. Its memory consumption is around 5Gb for 100M reads.

其他与 kissplice 有关的软件包

• dep: bcalm [除 alpha, hppa, m68k, sh4, x32]

  de Bruijn compaction in low memory

• dep: libc6 (>= 2.11) [hppa]

  GNU C 语言运行库：共享库
  同时作为一个虚包由这些包填实： libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.17) [sh4]

  dep: libc6 (>= 2.29) [x32]

  dep: libc6 (>= 2.38) [amd64, arm64, mips64el, ppc64, ppc64el, riscv64, sparc64]

  dep: libc6 (>= 2.39) [loong64]

  dep: libc6 (>= 2.4) [m68k]

• dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

  GNU C 语言运行库：共享库
  同时作为一个虚包由这些包填实： libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.4) [alpha]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, arm64, loong64, mips64el, ppc64, ppc64el, x32]

  GCC 支持库

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [sparc64]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.3) [riscv64]

• dep: libgcc1 (>= 1:4.1.1) [alpha]

  软件包暂时不可用

  dep: libgcc1 (>= 1:4.2.1) [sh4]

• dep: libgcc2 (>= 4.2.1) [m68k]

  软件包暂时不可用

• dep: libgcc4 (>= 4.1.1) [hppa]

  软件包暂时不可用

• dep: libgomp1 (>= 4.9) [除 alpha, hppa, m68k, sh4, x32]

  GCC OpenMP（GOMP）支持库

• dep: libstdc++6 (>= 13.1) [除 alpha, hppa, m68k, sh4, x32]

  GNU 标准 C++ 库，第3版

  dep: libstdc++6 (>= 4.6) [hppa, sh4]

  dep: libstdc++6 (>= 4.9) [alpha, m68k]

  dep: libstdc++6 (>= 9) [x32]

• dep: libunwind8 [ia64]

  library to determine the call-chain of a program - runtime

• dep: python [alpha, hppa, m68k, sh4]

  软件包暂时不可用

• dep: python3 [除 alpha, hppa, m68k, sh4]

  交互式高级面向对象语言（默认 python3 版本）

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4) [除 alpha, hppa, m68k, sh4]

  压缩库 - 运行时

  dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.4) [alpha, hppa, m68k, sh4]

下载 kissplice

下载可用于所有硬件架构的

硬件架构	版本	软件包大小	安装后大小	文件
alpha （非官方移植版）	2.2.1-1	596.7 kB	1,376.0 kB	[文件列表]
amd64	2.6.7-1	485.0 kB	1,178.0 kB	[文件列表]
arm64	2.6.7-1	469.8 kB	1,370.0 kB	[文件列表]
hppa （非官方移植版）	2.1.0-1	1,289.9 kB	2,181.0 kB	[文件列表]
ia64 （非官方移植版）	2.6.2-3	506.4 kB	1,581.0 kB	[文件列表]
loong64 （非官方移植版）	2.6.7-1	469.7 kB	1,146.0 kB	[文件列表]
m68k （非官方移植版）	2.2.1-1	555.8 kB	1,120.0 kB	[文件列表]
mips64el	2.6.7-1	486.1 kB	1,466.0 kB	[文件列表]
ppc64 （非官方移植版）	2.6.7-1	485.5 kB	1,434.0 kB	[文件列表]
ppc64el	2.6.7-1	486.5 kB	1,434.0 kB	[文件列表]
riscv64	2.6.7-1	480.3 kB	1,002.0 kB	[文件列表]
sh4 （非官方移植版）	2.1.0-1	1,282.1 kB	2,090.0 kB	[文件列表]
sparc64 （非官方移植版）	2.6.7-1	460.2 kB	7,783.0 kB	[文件列表]
x32 （非官方移植版）	2.5.3-1	4,035.5 kB	15,302.0 kB	[文件列表]