[ Source: kissplice ]
Пакунок: kissplice (2.6.7-1 and others)
Links for kissplice
Debian Resources:
Download Source Package kissplice:
Maintainers:
- Debian Med Packaging Team (QA Page, Mail Archive)
- Andreas Tille (QA Page)
- Francois Gindraud (QA Page)
External Resources:
- Homepage [kissplice.prabi.fr]
Similar packages:
Detection of various kinds of polymorphisms in RNA-seq data
KisSplice is a piece of software that enables the analysis of RNA-seq data with or without a reference genome. It is an exact local transcriptome assembler that allows one to identify SNPs, indels and alternative splicing events. It can deal with an arbitrary number of biological conditions, and will quantify each variant in each condition. It has been tested on Illumina datasets of up to 1G reads. Its memory consumption is around 5Gb for 100M reads.
Інші пакунки пов'язані з kissplice
|
|
|
|
-
- dep: bcalm [not alpha, hppa, m68k, sh4, x32]
- de Bruijn compaction in low memory
-
- dep: libc6 (>= 2.11) [hppa]
- Бібліотека GNU C: спільні бібліотеки
also a virtual package provided by libc6-udeb
- dep: libc6 (>= 2.17) [sh4]
- dep: libc6 (>= 2.29) [x32]
- dep: libc6 (>= 2.38) [amd64, arm64, mips64el, ppc64, ppc64el, riscv64, sparc64]
- dep: libc6 (>= 2.39) [loong64]
- dep: libc6 (>= 2.4) [m68k]
-
- dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]
- Бібліотека GNU C: спільні бібліотеки
also a virtual package provided by libc6.1-udeb
- dep: libc6.1 (>= 2.4) [alpha]
-
- dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, arm64, loong64, mips64el, ppc64, ppc64el, x32]
- Допоміжна бібліотека GCC
- dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [sparc64]
- dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]
- dep: libgcc-s1 (>= 4.3) [riscv64]
-
- dep: libgcc1 (>= 1:4.1.1) [alpha]
- Пакунок недоступний
- dep: libgcc1 (>= 1:4.2.1) [sh4]
-
- dep: libgcc2 (>= 4.2.1) [m68k]
- Пакунок недоступний
-
- dep: libgcc4 (>= 4.1.1) [hppa]
- Пакунок недоступний
-
- dep: libgomp1 (>= 4.9) [not alpha, hppa, m68k, sh4, x32]
- Підтримувальна бібліотека GCC OpenMP (GOMP)
-
- dep: libstdc++6 (>= 13.1) [not alpha, hppa, m68k, sh4, x32]
- Стандартна бібліотека C++ GNU, версії 3
- dep: libstdc++6 (>= 4.6) [hppa, sh4]
- dep: libstdc++6 (>= 4.9) [alpha, m68k]
- dep: libstdc++6 (>= 9) [x32]
-
- dep: libunwind8 [ia64]
- library to determine the call-chain of a program - runtime
-
- dep: python [alpha, hppa, m68k, sh4]
- Пакунок недоступний
-
- dep: python3 [not alpha, hppa, m68k, sh4]
- interactive high-level object-oriented language (default python3 version)
-
- dep: zlib1g (>= 1:1.1.4) [not alpha, hppa, m68k, sh4]
- Бібліотека стискання даних (виконавчий модуль)
- dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.4) [alpha, hppa, m68k, sh4]
Завантажити kissplice
| Архітектура | Версія | Розмір пакунка | Розмір після встановлення | Файли |
|---|---|---|---|---|
| alpha (unofficial port) | 2.2.1-1 | 596.7 kB | 1,376.0 kB | [список файлів] |
| amd64 | 2.6.7-1 | 485.0 kB | 1,178.0 kB | [список файлів] |
| arm64 | 2.6.7-1 | 469.8 kB | 1,370.0 kB | [список файлів] |
| hppa (unofficial port) | 2.1.0-1 | 1,289.9 kB | 2,181.0 kB | [список файлів] |
| ia64 (unofficial port) | 2.6.2-3 | 506.4 kB | 1,581.0 kB | [список файлів] |
| loong64 (unofficial port) | 2.6.7-1 | 469.7 kB | 1,146.0 kB | [список файлів] |
| m68k (unofficial port) | 2.2.1-1 | 555.8 kB | 1,120.0 kB | [список файлів] |
| mips64el | 2.6.7-1 | 486.1 kB | 1,466.0 kB | [список файлів] |
| ppc64 (unofficial port) | 2.6.7-1 | 485.5 kB | 1,434.0 kB | [список файлів] |
| ppc64el | 2.6.7-1 | 486.5 kB | 1,434.0 kB | [список файлів] |
| riscv64 | 2.6.7-1 | 480.3 kB | 1,002.0 kB | [список файлів] |
| sh4 (unofficial port) | 2.1.0-1 | 1,282.1 kB | 2,090.0 kB | [список файлів] |
| sparc64 (unofficial port) | 2.6.7-1 | 460.2 kB | 7,783.0 kB | [список файлів] |
| x32 (unofficial port) | 2.5.3-1 | 4,035.5 kB | 15,302.0 kB | [список файлів] |