Package: kissplice (2.6.2-2)

[ Source: kissplice  ]

rilevamento di vari tipi di polimorfismi in dati RNA-Seq

KisSplice è un software che permette l'analisi di dati RNA-Seq con o senza un genoma di riferimento. È un assemblatore esatto di trascrittoma che permette di identificare SNP, indel e eventi di splicing alternativo. Può lavorare con un numero arbitrario di condizioni biologiche e quantifica ciascuna variante in ogni condizione. È stato provato su insiemi di dati Illumina con fino a 1G di letture. Il suo consumo di memoria è di circa 5Gb per 100M letture.

Other Packages Related to kissplice

• dep: bcalm

  compattamento de Bruijn in poca memoria

• dep: libc6 (>= 2.34)

  Libreria C GNU: librerie condivise
  also a virtual package provided by libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0)

  libreria di supporto a GCC

• dep: libgomp1 (>= 4.9)

  libreria di supporto GOMP (GCC OpenMP)

• dep: libstdc++6 (>= 11)

  libreria GNU Standard C++, versione 3

• dep: python3

  interactive high-level object-oriented language (default python3 version)

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  libreria di compressione - runtime

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Architecture	Package Size	Installed Size	Files
amd64	484.5 kB	1,191.0 kB	[list of files]
arm64	472.5 kB	1,371.0 kB	[list of files]
mips64el	480.2 kB	1,467.0 kB	[list of files]
ppc64el	491.3 kB	1,435.0 kB	[list of files]