Balík: kissplice (2.6.7-1 a iné)

[ Zdroj: kissplice  ]

Detection of various kinds of polymorphisms in RNA-seq data

KisSplice is a piece of software that enables the analysis of RNA-seq data with or without a reference genome. It is an exact local transcriptome assembler that allows one to identify SNPs, indels and alternative splicing events. It can deal with an arbitrary number of biological conditions, and will quantify each variant in each condition. It has been tested on Illumina datasets of up to 1G reads. Its memory consumption is around 5Gb for 100M reads.

Ostatné balíky súvisiace s balíkom kissplice

• dep: bcalm [nie alpha, hppa, m68k, sh4, x32]

  de Bruijn compaction in low memory

• dep: libc6 (>= 2.11) [hppa]

  knižnica GNU C - zdieľané knižnice
  tiež virtuálny balík poskytovaný balíkom libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.17) [sh4]

  dep: libc6 (>= 2.29) [x32]

  dep: libc6 (>= 2.38) [nie alpha, hppa, ia64, m68k, sh4, x32]

  dep: libc6 (>= 2.4) [m68k]

• dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

  knižnica GNU C - zdieľané knižnice
  tiež virtuálny balík poskytovaný balíkom libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.4) [alpha]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, arm64, mips64el, ppc64, ppc64el, x32]

  podporná knižnica GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [sparc64]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.3) [riscv64]

• dep: libgcc1 (>= 1:4.1.1) [alpha]

  Balík nie je dostupný

  dep: libgcc1 (>= 1:4.2.1) [sh4]

• dep: libgcc2 (>= 4.2.1) [m68k]

  Balík nie je dostupný

• dep: libgcc4 (>= 4.1.1) [hppa]

  Balík nie je dostupný

• dep: libgomp1 (>= 4.9) [nie alpha, hppa, m68k, sh4, x32]

  podporná knižnica GCC OpenMP (GOMP)

• dep: libstdc++6 (>= 13.1) [nie alpha, hppa, m68k, sh4, x32]

  štandardná knižnica C++ GNU v3

  dep: libstdc++6 (>= 4.6) [hppa, sh4]

  dep: libstdc++6 (>= 4.9) [alpha, m68k]

  dep: libstdc++6 (>= 9) [x32]

• dep: libunwind8 [ia64]

  nnižnica na určenie na určenie postupnosti volania programu - dynamické súbory

• dep: python [alpha, hppa, m68k, sh4]

  Balík nie je dostupný

• dep: python3 [nie alpha, hppa, m68k, sh4]

  interactive high-level object-oriented language (default python3 version)

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4) [nie alpha, hppa, m68k, sh4]

  komprimačná knižnica - dynamická verzia

  dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.4) [alpha, hppa, m68k, sh4]

Stiahnuť kissplice

Stiahnuť pre všetky dostupné architektúry

Architektúra	Verzia	Veľkosť balíka	Nainštalovaná veľkosť	Súbory
alpha (neoficiálny port)	2.2.1-1	596.7 kB	1,376.0 kB	[zoznam súborov]
amd64	2.6.7-1	485.0 kB	1,178.0 kB	[zoznam súborov]
arm64	2.6.7-1	469.8 kB	1,370.0 kB	[zoznam súborov]
hppa (neoficiálny port)	2.1.0-1	1,289.9 kB	2,181.0 kB	[zoznam súborov]
ia64 (neoficiálny port)	2.6.2-3	506.4 kB	1,581.0 kB	[zoznam súborov]
m68k (neoficiálny port)	2.2.1-1	555.8 kB	1,120.0 kB	[zoznam súborov]
mips64el	2.6.7-1	486.1 kB	1,466.0 kB	[zoznam súborov]
ppc64 (neoficiálny port)	2.6.7-1	485.5 kB	1,434.0 kB	[zoznam súborov]
ppc64el	2.6.7-1	486.5 kB	1,434.0 kB	[zoznam súborov]
riscv64	2.6.7-1	480.3 kB	1,002.0 kB	[zoznam súborov]
sh4 (neoficiálny port)	2.1.0-1	1,282.1 kB	2,090.0 kB	[zoznam súborov]
sparc64 (neoficiálny port)	2.6.7-1	460.2 kB	7,783.0 kB	[zoznam súborov]
x32 (neoficiálny port)	2.5.3-1	4,035.5 kB	15,302.0 kB	[zoznam súborov]