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软件包:bwa(0.7.17-6 以及其他的)

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Burrows-Wheeler 比对工具

BWA 是一个用于将低差异序列比对到大型参考基因组(如人类基因组)的软件包。它包含三种算法:BWA-backtrack、BWA-SW 和 BWA-MEM。第一种算法适用于长度最多 100bp 的 Illumina 读段,而后两种算法适用于 70bp 至 1Mbp 之间的较长序列。BWA-MEM 和 BWA-SW 具有类似的特性,如对长读段的支持和分割比对,但 BWA-MEM 是最新的算法,通常推荐用于高质量的查询,因为它更快且更精确。此外,BWA-MEM 在处理 70-100bp 的 Illumina 读段时,比 BWA-backtrack 具有更好的性能。

标签: 生物学: 蛋白质, 领域: 生物学, field::biology:bioinformatics, implemented-in::c, 用户接口: 命令行, interface::text-mode, role::program, Purpose: Analysing, 比较

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