[ 源代码: bwa ]
软件包:bwa(0.7.17-6 以及其他的)
bwa 的相关链接
Debian 的资源:
下载源码包 bwa:
维护小组:
- Debian Med Packaging Team (QA 页面, 邮件存档)
- Charles Plessy (QA 页面)
- Andreas Tille (QA 页面)
- Carlos Borroto (QA 页面)
- Ognyan Kulev (QA 页面)
- Michael R. Crusoe (QA 页面)
外部的资源:
- 主页 [bio-bwa.sourceforge.net]
相似软件包:
Burrows-Wheeler 比对工具
BWA 是一个用于将低差异序列比对到大型参考基因组(如人类基因组)的软件包。它包含三种算法:BWA-backtrack、BWA-SW 和 BWA-MEM。第一种算法适用于长度最多 100bp 的 Illumina 读段,而后两种算法适用于 70bp 至 1Mbp 之间的较长序列。BWA-MEM 和 BWA-SW 具有类似的特性,如对长读段的支持和分割比对,但 BWA-MEM 是最新的算法,通常推荐用于高质量的查询,因为它更快且更精确。此外,BWA-MEM 在处理 70-100bp 的 Illumina 读段时,比 BWA-backtrack 具有更好的性能。
其他与 bwa 有关的软件包
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- dep: libc6 (>= 2.29)
- GNU C 语言运行库:共享库
同时作为一个虚包由这些包填实: libc6-udeb
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- dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)
- 压缩库 - 运行时
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- rec: perl
- 拉里 沃尔的实用报表提取语言(Perl)
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- sug: samtools
- processing sequence alignments in SAM, BAM and CRAM formats
下载 bwa
硬件架构 | 版本 | 软件包大小 | 安装后大小 | 文件 |
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amd64 | 0.7.17-6+b1 | 206.7 kB | 452.0 kB | [文件列表] |
arm64 | 0.7.17-6+b1 | 193.2 kB | 424.0 kB | [文件列表] |
armel | 0.7.17-6+b1 | 192.4 kB | 439.0 kB | [文件列表] |
armhf | 0.7.17-6+b1 | 192.6 kB | 327.0 kB | [文件列表] |
i386 | 0.7.17-6+b1 | 235.3 kB | 531.0 kB | [文件列表] |
mips64el | 0.7.17-6+b1 | 205.5 kB | 511.0 kB | [文件列表] |
mipsel | 0.7.17-6+b1 | 233.1 kB | 549.0 kB | [文件列表] |
ppc64el | 0.7.17-6+b1 | 224.3 kB | 580.0 kB | [文件列表] |
s390x | 0.7.17-6+b1 | 193.8 kB | 476.0 kB | [文件列表] |