Balík: kalign (1:3.3-1 a iné)

[ Zdroj: kalign  ]

Global and progressive multiple sequence alignment

Kalign is a command line tool to perform multiple alignment of biological sequences. It employs the Muth-Manber string-matching algorithm, to improve both the accuracy and speed of the alignment. It uses global, progressive alignment approach, enriched by employing an approximate string-matching algorithm to calculate sequence distances and by incorporating local matches into the otherwise global alignment.

Značky: Biológia: Clustal/ALN, Proteins, Pole: field::biology, field::biology:bioinformatics, Implementované v: implemented-in::c, interface::commandline, Role: Program, Scope: Utility, Purpose: use::comparing, works-with-format::plaintext, Works with: Need an extra tag

Ostatné balíky súvisiace s balíkom kalign

• dep: libc6 (>= 2.29)

  knižnica GNU C - zdieľané knižnice
  tiež virtuálny balík poskytovaný balíkom libc6-udeb

• dep: libgomp1 (>= 6)

  podporná knižnica GCC OpenMP (GOMP)

• enh: bioperl-run

  BioPerl wrappers: scripts

• enh: t-coffee

  Multiple Sequence Alignment

Stiahnuť kalign

Stiahnuť pre všetky dostupné architektúry

Architektúra	Verzia	Veľkosť balíka	Nainštalovaná veľkosť	Súbory
amd64	1:3.3-1+b3	133.4 kB	1,144.0 kB	[zoznam súborov]
arm64	1:3.3-1+b3	72.2 kB	217.0 kB	[zoznam súborov]
armel	1:3.3-1+b3	70.2 kB	207.0 kB	[zoznam súborov]
armhf	1:3.3-1+b3	67.5 kB	171.0 kB	[zoznam súborov]
i386	1:3.3-1+b3	173.4 kB	1,572.0 kB	[zoznam súborov]
mips64el	1:3.3-1+b3	71.1 kB	223.0 kB	[zoznam súborov]
mipsel	1:3.3-1+b3	71.7 kB	216.0 kB	[zoznam súborov]
ppc64el	1:3.3-1+b3	85.0 kB	341.0 kB	[zoznam súborov]
s390x	1:3.3-1+b3	73.3 kB	241.0 kB	[zoznam súborov]