Package: tree-ppuzzle (5.3~rc16+dfsg-12 and others)

[ Source: tree-puzzle  ]

Reconstrução paralelizada de árvores filogenéticas por máxima parecença

TREE-PUZZLE (o novo nome para PUZZLE) é um programa de consola interactivo que implementa um algoritmo rápido de pesquisa de árvore, intrigante em quarteto, que permite a análise de grandes conjuntos de dados e atribui automaticamente estimativas de suporte para cada ramo interno. TREE-PUZZLE também computa distâncias pareadas de máxima parecença assim como o alcance de ramificações para árvores especificadas pelo utilizador. O alcance das ramificações também pode ser calculado sub a assumpção de relógio. Adicionalmente, TREE-PUZZLE oferece um método inovador de mapeamento de parecenças, para investigar o suporte de um ramo interno hipotético sem computar uma árvore inteira e para visualizar o conteúdo filogenético de uma sequência de alinhamento.

Esta é uma versão paralela do tree-puzzle.

Tags: Field: Biology, Bioinformatics, Implemented in: implemented-in::c, interface::commandline, Role: Program, Scope: Utility, Purpose: use::analysing, use::comparing, Supports Format: Plain Text, Works with: Need an extra tag

Other Packages Related to tree-ppuzzle

• dep: libc6 (>= 2.34) [not alpha, ia64, sh4]

  Biblioteca GNU C: Bibliotecas partilhadas
  also a virtual package provided by libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.40) [sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

  Biblioteca GNU C: Bibliotecas partilhadas
  also a virtual package provided by libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

• dep: libmpich12 [armel, armhf, hppa, i386, m68k, sh4]

  Shared libraries for MPICH

  dep: libmpich12 (>= 4.2.0) [x32]

• dep: libopenmpi3t64 (>= 4.1.6) [ia64]

  high performance message passing library -- shared library

  dep: libopenmpi3t64 (>= 5.0.5) [not armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, sh4, x32]

• dep: libsprng2

  SPRNG Scalable Parallel RNG library -- library package

• dep: mpi-default-bin [not ia64]

  Standard MPI runtime programs (metapackage)

• dep: openmpi-bin [ia64]

  high performance message passing library -- binaries

• rec: tree-puzzle-doc

  Reconstruction of phylogenetic trees by maximum likelihood (doc)

• sug: phylip

  package of programs for inferring phylogenies

• sug: treetool

  Package not available

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Architecture	Version	Package Size	Installed Size	Files
alpha (unofficial port)	5.3~rc16+dfsg-12	182.9 kB	556.0 kB	[list of files]
amd64	5.3~rc16+dfsg-12	183.1 kB	440.0 kB	[list of files]
arm64	5.3~rc16+dfsg-12	167.5 kB	428.0 kB	[list of files]
armel	5.3~rc16+dfsg-12	176.1 kB	451.0 kB	[list of files]
armhf	5.3~rc16+dfsg-12	167.1 kB	331.0 kB	[list of files]
hppa (unofficial port)	5.3~rc16+dfsg-12	173.1 kB	436.0 kB	[list of files]
i386	5.3~rc16+dfsg-12	196.1 kB	539.0 kB	[list of files]
ia64 (unofficial port)	5.3~rc16+dfsg-9+b1	233.7 kB	860.0 kB	[list of files]
m68k (unofficial port)	5.3~rc16+dfsg-12	164.9 kB	451.0 kB	[list of files]
mips64el	5.3~rc16+dfsg-12	181.7 kB	574.0 kB	[list of files]
ppc64 (unofficial port)	5.3~rc16+dfsg-12	196.0 kB	556.0 kB	[list of files]
ppc64el	5.3~rc16+dfsg-12	193.5 kB	556.0 kB	[list of files]
riscv64	5.3~rc16+dfsg-12	186.5 kB	384.0 kB	[list of files]
s390x	5.3~rc16+dfsg-12	196.6 kB	491.0 kB	[list of files]
sh4 (unofficial port)	5.3~rc16+dfsg-12	198.7 kB	428.0 kB	[list of files]
sparc64 (unofficial port)	5.3~rc16+dfsg-12	167.9 kB	1,070.0 kB	[list of files]
x32 (unofficial port)	5.3~rc16+dfsg-12	178.9 kB	419.0 kB	[list of files]