Pacote: tree-ppuzzle (5.3~rc16+dfsg-12 e outros)

[ Fonte: tree-puzzle  ]

reconstrução paralelizada de árvores filogenéticas por máxima probabilidade

TREE-PUZZLE (o novo nome para o PUZZLE) é um programa interativo para console que implementa um algoritmo de procura rápida em árvore, "quartet puzzling", que permite análise de grandes conjuntos de dados e automaticamente atribui estimativas de suporte para cada ramo interno. TREE-PUZZLE oferece um método novo, com mapeamento por estimativa, para investigar o suporte a um ramo interno hipotético sem computar uma árvore completa e visualizar o conteúdo filogenético de um alinhamento de seqüência.

Esta é a versão paralelizada do tree-puzzle.

Etiquetas: Campo: Biologia, Bioinformática, Implementado em: implemented-in::c, interface::commandline, Função: Programa, Alcance: Utilitários, Propósito: use::analysing, use::comparing, Suporta o formato: Texto puro, Funciona com: Precisa de uma etiqueta extra

Outros pacotes relacionados a tree-ppuzzle

• dep: libc6 (>= 2.34) [não alpha, ia64, loong64, sh4]

  GNU Biblioteca C: Bibliotecas compartilhadas
  também um pacote virtual fornecido por libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.40) [loong64, sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

  GNU Biblioteca C: Bibliotecas compartilhadas
  também um pacote virtual fornecido por libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

• dep: libmpich12 [armel, armhf, hppa, i386, m68k, sh4]

  Shared libraries for MPICH

  dep: libmpich12 (>= 4.2.0) [x32]

• dep: libopenmpi3t64 (>= 4.1.6) [ia64]

  high performance message passing library -- shared library

• dep: libopenmpi40 (>= 5.0.6) [não armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, sh4, x32]

  high performance message passing library -- shared library

• dep: libsprng2

  SPRNG Scalable Parallel RNG library -- library package

• dep: mpi-default-bin [não ia64]

  Standard MPI runtime programs (metapackage)

• dep: openmpi-bin [ia64]

  biblioteca de passagem de mensagens de alto desempenho -- binários

• rec: tree-puzzle-doc

  Reconstruction of phylogenetic trees by maximum likelihood (doc)

• sug: phylip

  package of programs for inferring phylogenies

• sug: treetool

  Pacote não disponível

Download de tree-ppuzzle

Baixe para todas as arquiteturas disponíveis

Arquitetura	Versão	Tamanho do pacote	Tamanho instalado	Arquivos
alpha (porte não oficial)	5.3~rc16+dfsg-12+b1	183.1 kB	557.0 kB	[lista de arquivos]
amd64	5.3~rc16+dfsg-12+b1	183.4 kB	441.0 kB	[lista de arquivos]
arm64	5.3~rc16+dfsg-12+b1	167.8 kB	429.0 kB	[lista de arquivos]
armel	5.3~rc16+dfsg-12	176.1 kB	451.0 kB	[lista de arquivos]
armhf	5.3~rc16+dfsg-12	167.1 kB	331.0 kB	[lista de arquivos]
hppa (porte não oficial)	5.3~rc16+dfsg-12	173.1 kB	436.0 kB	[lista de arquivos]
i386	5.3~rc16+dfsg-12	196.1 kB	539.0 kB	[lista de arquivos]
ia64 (porte não oficial)	5.3~rc16+dfsg-9+b1	233.7 kB	860.0 kB	[lista de arquivos]
loong64 (porte não oficial)	5.3~rc16+dfsg-12+b1	175.1 kB	444.0 kB	[lista de arquivos]
m68k (porte não oficial)	5.3~rc16+dfsg-12	164.9 kB	451.0 kB	[lista de arquivos]
mips64el	5.3~rc16+dfsg-12+b1	185.6 kB	575.0 kB	[lista de arquivos]
ppc64 (porte não oficial)	5.3~rc16+dfsg-12+b1	196.3 kB	557.0 kB	[lista de arquivos]
ppc64el	5.3~rc16+dfsg-12+b1	193.8 kB	557.0 kB	[lista de arquivos]
riscv64	5.3~rc16+dfsg-12+b1	186.8 kB	385.0 kB	[lista de arquivos]
s390x	5.3~rc16+dfsg-12+b1	196.9 kB	492.0 kB	[lista de arquivos]
sh4 (porte não oficial)	5.3~rc16+dfsg-12	198.7 kB	428.0 kB	[lista de arquivos]
sparc64 (porte não oficial)	5.3~rc16+dfsg-12+b1	168.1 kB	1,071.0 kB	[lista de arquivos]
x32 (porte não oficial)	5.3~rc16+dfsg-12	178.9 kB	419.0 kB	[lista de arquivos]