Package: tree-ppuzzle (5.3~rc16+dfsg-12 and others)

[ Source: tree-puzzle  ]

최대 가능성에 의한 계통 발생 수의 병렬 재구성

TREE-PUZZLE (PUZZLE의 새로운 이름)은 대규모 데이터 세트를 분석하고 각 내부 분기에 대한 지원 추정치를 자동으로 할당하는, 빠른 트리 검색 알고리즘, quartet puzzling을 구현하는 대화형 콘솔입니다. TREE-PUZZLE은 또한 사용자가 지정한 트리에 대한 브렌치 길이뿐만 아니라 쌍별 최대 우도 거리도 계산합니다. 브렌치 길이는 클록 가정에 따라 계산될 수도 있습니다. 또한 TREE-PUZZLE은 전체 트리를 계산하지 않고 가정된 내부 브렌치의 지원을 조사하고 서열 정렬의 계통발생적 내용을 시각화하기 위해 새로운 방법인, 우도 매핑을 제공합니다.

Tags: Field: Biology, Bioinformatics, Implemented in: implemented-in::c, interface::commandline, Role: Program, Scope: Utility, Purpose: use::analysing, use::comparing, Supports Format: Plain Text, Works with: Need an extra tag

Other Packages Related to tree-ppuzzle

• dep: libc6 (>= 2.34) [not alpha, ia64, loong64, sh4]

  GNU C 라이브러리: 공유 라이브러리
  also a virtual package provided by libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.40) [loong64, sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

  GNU C 라이브러리: 공유 라이브러리
  also a virtual package provided by libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

• dep: libmpich12 [armel, armhf, hppa, i386, m68k, sh4]

  Shared libraries for MPICH

  dep: libmpich12 (>= 4.2.0) [x32]

• dep: libopenmpi3t64 (>= 4.1.6) [ia64]

  high performance message passing library -- shared library

• dep: libopenmpi40 (>= 5.0.6) [not armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, sh4, x32]

  high performance message passing library -- shared library

• dep: libsprng2

  SPRNG Scalable Parallel RNG library -- library package

• dep: mpi-default-bin [not ia64]

  Standard MPI runtime programs (metapackage)

• dep: openmpi-bin [ia64]

  high performance message passing library -- binaries

• rec: tree-puzzle-doc

  Reconstruction of phylogenetic trees by maximum likelihood (doc)

• sug: phylip

  package of programs for inferring phylogenies

• sug: treetool

  Package not available

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Architecture	Version	Package Size	Installed Size	Files
alpha (unofficial port)	5.3~rc16+dfsg-12+b1	183.1 kB	557.0 kB	[list of files]
amd64	5.3~rc16+dfsg-12+b1	183.4 kB	441.0 kB	[list of files]
arm64	5.3~rc16+dfsg-12+b1	167.8 kB	429.0 kB	[list of files]
armel	5.3~rc16+dfsg-12	176.1 kB	451.0 kB	[list of files]
armhf	5.3~rc16+dfsg-12	167.1 kB	331.0 kB	[list of files]
hppa (unofficial port)	5.3~rc16+dfsg-12	173.1 kB	436.0 kB	[list of files]
i386	5.3~rc16+dfsg-12	196.1 kB	539.0 kB	[list of files]
ia64 (unofficial port)	5.3~rc16+dfsg-9+b1	233.7 kB	860.0 kB	[list of files]
loong64 (unofficial port)	5.3~rc16+dfsg-12+b1	175.1 kB	444.0 kB	[list of files]
m68k (unofficial port)	5.3~rc16+dfsg-12	164.9 kB	451.0 kB	[list of files]
mips64el	5.3~rc16+dfsg-12+b1	185.6 kB	575.0 kB	[list of files]
ppc64 (unofficial port)	5.3~rc16+dfsg-12+b1	196.3 kB	557.0 kB	[list of files]
ppc64el	5.3~rc16+dfsg-12+b1	193.8 kB	557.0 kB	[list of files]
riscv64	5.3~rc16+dfsg-12+b1	186.8 kB	385.0 kB	[list of files]
s390x	5.3~rc16+dfsg-12+b1	196.9 kB	492.0 kB	[list of files]
sh4 (unofficial port)	5.3~rc16+dfsg-12	198.7 kB	428.0 kB	[list of files]
sparc64 (unofficial port)	5.3~rc16+dfsg-12+b1	168.1 kB	1,071.0 kB	[list of files]
x32 (unofficial port)	5.3~rc16+dfsg-12	178.9 kB	419.0 kB	[list of files]