[ 原始碼： seqan-raptor ]
套件：seqan-raptor（3.0.1+ds-9 以及其他的）
seqan-raptor 的相關連結
Debian 的資源：
下載原始碼套件 seqan-raptor：
- [seqan-raptor_3.0.1+ds-9.dsc]
- [seqan-raptor_3.0.1+ds.orig.tar.xz]
- [seqan-raptor_3.0.1+ds-9.debian.tar.xz]
維護小組：
外部的資源：
- 主頁 [github.com]
相似套件：
pre-filter for querying very large collections of nucleotide sequences
Raptor is a system for approximately searching many queries such as next-generation sequencing reads or transcripts in large collections of nucleotide sequences. Raptor uses winnowing minimizers to define a set of representative k-mers, an extension of the interleaved Bloom filters (IBFs) as a set membership data structure and probabilistic thresholding for minimizers. This approach allows compression and partitioning of the IBF to enable the effective use of secondary memory.
其他與 seqan-raptor 有關的套件
|
|
|
|
-
- dep: libbz2-1.0
- high-quality block-sorting file compressor library - runtime
-
- dep: libc6 (>= 2.34) [除 alpha, ia64, loong64]
- GNU C 函式庫：共用函式庫
同時作為一個虛擬套件由這些套件填實： libc6-udeb
- dep: libc6 (>= 2.40) [loong64]
-
- dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]
- GNU C 函式庫：共用函式庫
同時作為一個虛擬套件由這些套件填實： libc6.1-udeb
- dep: libc6.1 (>= 2.35) [ia64]
-
- dep: libgcc-s1 (>= 3.3.1) [amd64, arm64, loong64, ppc64el]
- GCC 支援函式庫
- dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, mips64el, ppc64, riscv64]
- dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]
- dep: libgcc-s1 (>= 4.3) [sparc64]
-
- dep: libgomp1 (>= 6)
- GCC OpenMP (GOMP) support library
-
- dep: libstdc++6 (>= 12) [ia64]
- GNU Standard C++ Library v3
- dep: libstdc++6 (>= 13.1) [ppc64, sparc64]
- dep: libstdc++6 (>= 14) [除 ia64, ppc64, sparc64]
-
- dep: libunwind8 [ia64]
- library to determine the call-chain of a program - runtime
-
- dep: libxxhash0 (>= 0.6.5) [sparc64]
- shared library for xxhash
-
- dep: libyaml-cpp0.7 (>= 0.7.0) [sparc64]
- YAML parser and emitter for C++
-
- dep: libyaml-cpp0.8 (>= 0.7.0) [除 ia64, ppc64, sparc64]
- YAML parser and emitter for C++
-
- dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)
- 壓縮函式庫 - 跑程式時用(runtime)
-
- sug: cwl-runner
- 本虛擬套件由這些套件填實： cwltool, toil
下載 seqan-raptor
| 硬體架構 | 版本 | 套件大小 | 安裝後大小 | 檔案 |
|---|---|---|---|---|
| alpha （非官方移植版） | 3.0.1+ds-9 | 590。3 kB | 2，427。0 kB | [檔案列表] |
| amd64 | 3.0.1+ds-9 | 679。0 kB | 2，216。0 kB | [檔案列表] |
| arm64 | 3.0.1+ds-9 | 576。8 kB | 2，040。0 kB | [檔案列表] |
| ia64 （非官方移植版） | 2.0.0.0.git.fecfbca+ds-3 | 695。6 kB | 4，733。0 kB | [檔案列表] |
| loong64 （非官方移植版） | 3.0.1+ds-9 | 621。1 kB | 2，040。0 kB | [檔案列表] |
| mips64el | 3.0.1+ds-9 | 550。2 kB | 2，448。0 kB | [檔案列表] |
| ppc64 （非官方移植版） | 3.0.0+ds-2 | 458。7 kB | 1，831。0 kB | [檔案列表] |
| ppc64el | 3.0.1+ds-9 | 656。0 kB | 2，424。0 kB | [檔案列表] |
| riscv64 | 3.0.1+ds-9 | 653。2 kB | 1，616。0 kB | [檔案列表] |
| sparc64 （非官方移植版） | 3.0.1+ds-2 | 473。3 kB | 2，111。0 kB | [檔案列表] |