Pakiet: seqan-raptor (3.0.1+ds-9 i inne)

[ Pakiet źródłowy: seqan-raptor  ]

pre-filter for querying very large collections of nucleotide sequences

Raptor is a system for approximately searching many queries such as next-generation sequencing reads or transcripts in large collections of nucleotide sequences. Raptor uses winnowing minimizers to define a set of representative k-mers, an extension of the interleaved Bloom filters (IBFs) as a set membership data structure and probabilistic thresholding for minimizers. This approach allows compression and partitioning of the IBF to enable the effective use of secondary memory.

Inne pakiety związane z seqan-raptor

• dep: libbz2-1.0

  Wysokiej jakości biblioteka kompresji plików - wersja uruchomieniowa

• dep: libc6 (>= 2.34) [nie alpha, ia64, loong64]

  Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
  również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.40) [loong64]

• dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

  Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
  również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.35) [ia64]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.3.1) [amd64, arm64, loong64, ppc64el]

  Biblioteka wspomagająca GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, mips64el, ppc64, riscv64]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.3) [sparc64]

• dep: libgomp1 (>= 6)

  Biblioteka wspierająca GCC OpenMP (GOMP)

• dep: libstdc++6 (>= 12) [ia64]

  Standardowa biblioteka GNU C++, wersja 3

  dep: libstdc++6 (>= 13.1) [ppc64, sparc64]

  dep: libstdc++6 (>= 14) [nie ia64, ppc64, sparc64]

• dep: libunwind8 [ia64]

  Biblioteka do ustalania łańcucha wywołań programu - środowisko uruchomieniowe

• dep: libxxhash0 (>= 0.6.5) [sparc64]

  Biblioteka współdzielona do xxhash

• dep: libyaml-cpp0.7 (>= 0.7.0) [sparc64]

  YAML parser and emitter for C++

• dep: libyaml-cpp0.8 (>= 0.7.0) [nie ia64, ppc64, sparc64]

  YAML parser and emitter for C++

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  Biblioteka kompresyjna - pliki wykonawcze

• sug: cwl-runner

  pakiet wirtualny udostępniany przez cwltool, toil

Pobieranie seqan-raptor

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur

Architektura	Wersja	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
alpha (port nieoficjalny)	3.0.1+ds-9	590,3 KiB	2 427,0 KiB	[lista plików]
amd64	3.0.1+ds-9	679,0 KiB	2 216,0 KiB	[lista plików]
arm64	3.0.1+ds-9	576,8 KiB	2 040,0 KiB	[lista plików]
ia64 (port nieoficjalny)	2.0.0.0.git.fecfbca+ds-3	695,6 KiB	4 733,0 KiB	[lista plików]
loong64 (port nieoficjalny)	3.0.1+ds-9	621,1 KiB	2 040,0 KiB	[lista plików]
mips64el	3.0.1+ds-9	550,2 KiB	2 448,0 KiB	[lista plików]
ppc64 (port nieoficjalny)	3.0.0+ds-2	458,7 KiB	1 831,0 KiB	[lista plików]
ppc64el	3.0.1+ds-9	656,0 KiB	2 424,0 KiB	[lista plików]
riscv64	3.0.1+ds-9	653,2 KiB	1 616,0 KiB	[lista plików]
sparc64 (port nieoficjalny)	3.0.1+ds-2	473,3 KiB	2 111,0 KiB	[lista plików]