套件：maq（0.7.1-10 以及其他的）

[ 原始碼： maq  ]

maps short fixed-length polymorphic DNA sequence reads to reference sequences

Maq (short for Mapping and Assembly with Quality) builds mapping assemblies from short reads generated by the next-generation sequencing machines. It was particularly designed for Illumina-Solexa 1G Genetic Analyzer, and has a preliminary functionality to handle ABI SOLiD data. Maq is previously known as mapass2.

Developmemt of Maq stopped in 2008. Its successors are BWA and SAMtools.

標籤: 領域: 生物學, 生物資訊學, 實做語言: implemented-in::c++, implemented-in::perl, 使用者介面: 命令行, 角色: role::program, scope::utility, Purpose: 需要一個額外的標籤, Analysing, use::comparing, use::searching, 支援的格式: 需要一個額外的標籤, works-with-format::plaintext, works-with::TODO

其他與 maq 有關的套件

• dep: libc6 (>= 2.38) [除 alpha, ia64, loong64, sh4]

  GNU C 函式庫：共用函式庫
  同時作為一個虛擬套件由這些套件填實： libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.39) [loong64, sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.31) [ia64]

  GNU C 函式庫：共用函式庫
  同時作為一個虛擬套件由這些套件填實： libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.38) [alpha]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [sparc64]

  GCC 支援函式庫

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [arm64, i386, ia64, loong64, mips64el, ppc64, ppc64el, riscv64, sh4]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  GCC 支援函式庫

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  GCC 支援函式庫

• dep: libstdc++6 (>= 5)

  GNU Standard C++ Library v3

• dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.3)

  壓縮函式庫 - 跑程式時用(runtime)

• sug: bwa

  Burrows-Wheeler Aligner

• sug: samtools

  processing sequence alignments in SAM, BAM and CRAM formats

下載 maq

下載可用於所有硬體架構的

硬體架構	版本	套件大小	安裝後大小	檔案
alpha （非官方移植版）	0.7.1-10	297。2 kB	582。0 kB	[檔案列表]
amd64	0.7.1-10	295。1 kB	545。0 kB	[檔案列表]
arm64	0.7.1-10	287。3 kB	581。0 kB	[檔案列表]
armel	0.7.1-10	284。3 kB	524。0 kB	[檔案列表]
armhf	0.7.1-10	286。4 kB	472。0 kB	[檔案列表]
hppa （非官方移植版）	0.7.1-10	304。9 kB	553。0 kB	[檔案列表]
i386	0.7.1-10	305。4 kB	581。0 kB	[檔案列表]
ia64 （非官方移植版）	0.7.1-9	329。5 kB	752。0 kB	[檔案列表]
loong64 （非官方移植版）	0.7.1-10	291。9 kB	533。0 kB	[檔案列表]
m68k （非官方移植版）	0.7.1-10	295。5 kB	556。0 kB	[檔案列表]
mips64el	0.7.1-10	296。6 kB	588。0 kB	[檔案列表]
ppc64 （非官方移植版）	0.7.1-10	300。7 kB	645。0 kB	[檔案列表]
ppc64el	0.7.1-10	303。5 kB	645。0 kB	[檔案列表]
riscv64	0.7.1-10	296。8 kB	493。0 kB	[檔案列表]
s390x	0.7.1-10	299。0 kB	557。0 kB	[檔案列表]
sh4 （非官方移植版）	0.7.1-10	316。1 kB	581。0 kB	[檔案列表]
sparc64 （非官方移植版）	0.7.1-10	290。1 kB	1，352。0 kB	[檔案列表]
x32 （非官方移植版）	0.7.1-10	296。3 kB	545。0 kB	[檔案列表]