Пакунок: probalign (1.4-10 and others)

[ Source: probalign  ]

multiple sequence alignment using partition function posterior probabilities

Probalign uses partition function posterior probability estimates to compute maximum expected accuracy multiple sequence alignments. It performs statistically significantly better than the leading alignment programs Probcons v1.1, MAFFT v5.851, and MUSCLE v3.6 on BAliBASE 3.0, HOMSTRAD, and OXBENCH benchmarks. Probalign improvements are largest on datasets containing N/C terminal extensions and on datasets with long and heterogeneous length sequences. On heteregeneous length datasets containing repeats Probalign alignment accuracy is 10% and 15% higher than the other three methods when standard deviation of length is at least 300 and 400.

Інші пакунки пов'язані з probalign

• dep: libc6 (>= 2.34) [not alpha, arm64, ia64, sh4]

  Бібліотека GNU C: спільні бібліотеки
  also a virtual package provided by libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.36) [sh4]

  dep: libc6 (>= 2.38) [arm64]

• dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

  Бібліотека GNU C: спільні бібліотеки
  also a virtual package provided by libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.36) [ia64]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [not armel, armhf, hppa, ia64, m68k, ppc64, ppc64el, sh4]

  Допоміжна бібліотека GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.3.4) [sh4]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4.4) [ppc64, ppc64el]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  Допоміжна бібліотека GCC

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  Допоміжна бібліотека GCC

• dep: libstdc++6 (>= 11) [not arm64, riscv64]

  Стандартна бібліотека C++ GNU, версії 3

  dep: libstdc++6 (>= 13.1) [arm64, riscv64]

• dep: libunwind8 [ia64]

  library to determine the call-chain of a program - runtime

Завантажити probalign

Завантаження для всіх доступних архітектур

Архітектура	Версія	Розмір пакунка	Розмір після встановлення	Файли
alpha (unofficial port)	1.4-10	69.0 kB	220.0 kB	[список файлів]
amd64	1.4-10	68.9 kB	175.0 kB	[список файлів]
arm64	1.4-10+b1	66.9 kB	220.0 kB	[список файлів]
armel	1.4-10	55.1 kB	142.0 kB	[список файлів]
armhf	1.4-10	53.9 kB	114.0 kB	[список файлів]
hppa (unofficial port)	1.4-10	66.9 kB	156.0 kB	[список файлів]
i386	1.4-10	61.4 kB	158.0 kB	[список файлів]
ia64 (unofficial port)	1.4-10	97.8 kB	292.0 kB	[список файлів]
m68k (unofficial port)	1.4-10	60.2 kB	162.0 kB	[список файлів]
mips64el	1.4-10	65.4 kB	223.0 kB	[список файлів]
ppc64 (unofficial port)	1.4-10	70.0 kB	219.0 kB	[список файлів]
ppc64el	1.4-10	78.4 kB	219.0 kB	[список файлів]
riscv64	1.4-10+b1	67.4 kB	132.0 kB	[список файлів]
s390x	1.4-10	56.7 kB	171.0 kB	[список файлів]
sh4 (unofficial port)	1.4-10	72.5 kB	155.0 kB	[список файлів]
sparc64 (unofficial port)	1.4-10	60.5 kB	1,054.0 kB	[список файлів]
x32 (unofficial port)	1.4-10	70.0 kB	170.0 kB	[список файлів]