Pacote: probalign (1.4-10 e outros)

[ Fonte: probalign  ]

multiple sequence alignment using partition function posterior probabilities

Probalign uses partition function posterior probability estimates to compute maximum expected accuracy multiple sequence alignments. It performs statistically significantly better than the leading alignment programs Probcons v1.1, MAFFT v5.851, and MUSCLE v3.6 on BAliBASE 3.0, HOMSTRAD, and OXBENCH benchmarks. Probalign improvements are largest on datasets containing N/C terminal extensions and on datasets with long and heterogeneous length sequences. On heteregeneous length datasets containing repeats Probalign alignment accuracy is 10% and 15% higher than the other three methods when standard deviation of length is at least 300 and 400.

Outros pacotes relacionados a probalign

• dep: libc6 (>= 2.34) [não alpha, arm64, ia64, loong64, sh4]

  GNU Biblioteca C: Bibliotecas compartilhadas
  também um pacote virtual fornecido por libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.36) [loong64, sh4]

  dep: libc6 (>= 2.38) [arm64]

• dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

  GNU Biblioteca C: Bibliotecas compartilhadas
  também um pacote virtual fornecido por libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.36) [ia64]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [não armel, armhf, hppa, ia64, m68k, ppc64, ppc64el, sh4]

  Biblioteca de suporte GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.3.4) [sh4]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4.4) [ppc64, ppc64el]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  Biblioteca de suporte GCC

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  Biblioteca de suporte GCC

• dep: libstdc++6 (>= 11) [não arm64, riscv64]

  Biblioteca C++ padrão da GNU v3

  dep: libstdc++6 (>= 13.1) [arm64, riscv64]

• dep: libunwind8 [ia64]

  biblioteca para determinar a cadeia de chamadas de um programa - execução

Download de probalign

Baixe para todas as arquiteturas disponíveis

Arquitetura	Versão	Tamanho do pacote	Tamanho instalado	Arquivos
alpha (porte não oficial)	1.4-10	69.0 kB	220.0 kB	[lista de arquivos]
amd64	1.4-10	68.9 kB	175.0 kB	[lista de arquivos]
arm64	1.4-10+b1	66.9 kB	220.0 kB	[lista de arquivos]
armel	1.4-10	55.1 kB	142.0 kB	[lista de arquivos]
armhf	1.4-10	53.9 kB	114.0 kB	[lista de arquivos]
hppa (porte não oficial)	1.4-10	66.9 kB	156.0 kB	[lista de arquivos]
i386	1.4-10	61.4 kB	158.0 kB	[lista de arquivos]
ia64 (porte não oficial)	1.4-10	97.8 kB	292.0 kB	[lista de arquivos]
loong64 (porte não oficial)	1.4-10	62.1 kB	156.0 kB	[lista de arquivos]
m68k (porte não oficial)	1.4-10	60.2 kB	162.0 kB	[lista de arquivos]
mips64el	1.4-10	65.4 kB	223.0 kB	[lista de arquivos]
ppc64 (porte não oficial)	1.4-10	70.0 kB	219.0 kB	[lista de arquivos]
ppc64el	1.4-10	78.4 kB	219.0 kB	[lista de arquivos]
riscv64	1.4-10+b1	67.4 kB	132.0 kB	[lista de arquivos]
s390x	1.4-10	56.7 kB	171.0 kB	[lista de arquivos]
sh4 (porte não oficial)	1.4-10	72.5 kB	155.0 kB	[lista de arquivos]
sparc64 (porte não oficial)	1.4-10	60.5 kB	1,054.0 kB	[lista de arquivos]
x32 (porte não oficial)	1.4-10	70.0 kB	170.0 kB	[lista de arquivos]