Пакет: probalign (1.4-10 и други)

[ Източник: probalign  ]

multiple sequence alignment using partition function posterior probabilities

Probalign uses partition function posterior probability estimates to compute maximum expected accuracy multiple sequence alignments. It performs statistically significantly better than the leading alignment programs Probcons v1.1, MAFFT v5.851, and MUSCLE v3.6 on BAliBASE 3.0, HOMSTRAD, and OXBENCH benchmarks. Probalign improvements are largest on datasets containing N/C terminal extensions and on datasets with long and heterogeneous length sequences. On heteregeneous length datasets containing repeats Probalign alignment accuracy is 10% and 15% higher than the other three methods when standard deviation of length is at least 300 and 400.

Други пакети, свързани с probalign

• dep: libc6 (>= 2.34) [не alpha, arm64, ia64, sh4]

  GNU C Library: Shared libraries
  също и виртуален пакет, предлаган от libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.36) [sh4]

  dep: libc6 (>= 2.38) [arm64]

• dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

  GNU C Library: Shared libraries
  също и виртуален пакет, предлаган от libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.36) [ia64]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [не armel, armhf, hppa, ia64, m68k, ppc64, ppc64el, sh4]

  GCC support library

  dep: libgcc-s1 (>= 3.3.4) [sh4]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4.4) [ppc64, ppc64el]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  GCC support library

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  GCC support library

• dep: libstdc++6 (>= 11) [не arm64, riscv64]

  GNU Standard C++ Library v3

  dep: libstdc++6 (>= 13.1) [arm64, riscv64]

• dep: libunwind8 [ia64]

  library to determine the call-chain of a program - runtime

Изтегляне на probalign

Изтегляне за всички налични архитектури

Архитектура	Версия	Големина на пакета	Големина след инсталиране	Файлове
alpha (неофициална архитектура)	1.4-10	69,0 кБ	220,0 кБ	[списък на файловете]
amd64	1.4-10	68,9 кБ	175,0 кБ	[списък на файловете]
arm64	1.4-10+b1	66,9 кБ	220,0 кБ	[списък на файловете]
armel	1.4-10	55,1 кБ	142,0 кБ	[списък на файловете]
armhf	1.4-10	53,9 кБ	114,0 кБ	[списък на файловете]
hppa (неофициална архитектура)	1.4-10	66,9 кБ	156,0 кБ	[списък на файловете]
i386	1.4-10	61,4 кБ	158,0 кБ	[списък на файловете]
ia64 (неофициална архитектура)	1.4-10	97,8 кБ	292,0 кБ	[списък на файловете]
m68k (неофициална архитектура)	1.4-10	60,2 кБ	162,0 кБ	[списък на файловете]
mips64el	1.4-10	65,4 кБ	223,0 кБ	[списък на файловете]
ppc64 (неофициална архитектура)	1.4-10	70,0 кБ	219,0 кБ	[списък на файловете]
ppc64el	1.4-10	78,4 кБ	219,0 кБ	[списък на файловете]
riscv64	1.4-10+b1	67,4 кБ	132,0 кБ	[списък на файловете]
s390x	1.4-10	56,7 кБ	171,0 кБ	[списък на файловете]
sh4 (неофициална архитектура)	1.4-10	72,5 кБ	155,0 кБ	[списък на файловете]
sparc64 (неофициална архитектура)	1.4-10	60,5 кБ	1 054,0 кБ	[списък на файловете]
x32 (неофициална архитектура)	1.4-10	70,0 кБ	170,0 кБ	[списък на файловете]