Balík: probalign (1.4-10 a iné)

[ Zdroj: probalign  ]

multiple sequence alignment using partition function posterior probabilities

Probalign uses partition function posterior probability estimates to compute maximum expected accuracy multiple sequence alignments. It performs statistically significantly better than the leading alignment programs Probcons v1.1, MAFFT v5.851, and MUSCLE v3.6 on BAliBASE 3.0, HOMSTRAD, and OXBENCH benchmarks. Probalign improvements are largest on datasets containing N/C terminal extensions and on datasets with long and heterogeneous length sequences. On heteregeneous length datasets containing repeats Probalign alignment accuracy is 10% and 15% higher than the other three methods when standard deviation of length is at least 300 and 400.

Ostatné balíky súvisiace s balíkom probalign

• dep: libc6 (>= 2.34) [nie alpha, arm64, ia64, sh4]

  knižnica GNU C - zdieľané knižnice
  tiež virtuálny balík poskytovaný balíkom libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.36) [sh4]

  dep: libc6 (>= 2.38) [arm64]

• dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

  knižnica GNU C - zdieľané knižnice
  tiež virtuálny balík poskytovaný balíkom libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.36) [ia64]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [nie armel, armhf, hppa, ia64, m68k, ppc64, ppc64el, sh4]

  podporná knižnica GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.3.4) [sh4]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4.4) [ppc64, ppc64el]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  podporná knižnica GCC

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  podporná knižnica GCC

• dep: libstdc++6 (>= 11) [nie arm64, riscv64]

  štandardná knižnica C++ GNU v3

  dep: libstdc++6 (>= 13.1) [arm64, riscv64]

• dep: libunwind8 [ia64]

  nnižnica na určenie na určenie postupnosti volania programu - dynamické súbory

Stiahnuť probalign

Stiahnuť pre všetky dostupné architektúry

Architektúra	Verzia	Veľkosť balíka	Nainštalovaná veľkosť	Súbory
alpha (neoficiálny port)	1.4-10	69.0 kB	220.0 kB	[zoznam súborov]
amd64	1.4-10	68.9 kB	175.0 kB	[zoznam súborov]
arm64	1.4-10+b1	66.9 kB	220.0 kB	[zoznam súborov]
armel	1.4-10	55.1 kB	142.0 kB	[zoznam súborov]
armhf	1.4-10	53.9 kB	114.0 kB	[zoznam súborov]
hppa (neoficiálny port)	1.4-10	66.9 kB	156.0 kB	[zoznam súborov]
i386	1.4-10	61.4 kB	158.0 kB	[zoznam súborov]
ia64 (neoficiálny port)	1.4-10	97.8 kB	292.0 kB	[zoznam súborov]
m68k (neoficiálny port)	1.4-10	60.2 kB	162.0 kB	[zoznam súborov]
mips64el	1.4-10	65.4 kB	223.0 kB	[zoznam súborov]
ppc64 (neoficiálny port)	1.4-10	70.0 kB	219.0 kB	[zoznam súborov]
ppc64el	1.4-10	78.4 kB	219.0 kB	[zoznam súborov]
riscv64	1.4-10+b1	67.4 kB	132.0 kB	[zoznam súborov]
s390x	1.4-10	56.7 kB	171.0 kB	[zoznam súborov]
sh4 (neoficiálny port)	1.4-10	72.5 kB	155.0 kB	[zoznam súborov]
sparc64 (neoficiálny port)	1.4-10	60.5 kB	1,054.0 kB	[zoznam súborov]
x32 (neoficiálny port)	1.4-10	70.0 kB	170.0 kB	[zoznam súborov]