Paket: probalign (1.4-10 und andere)

[ Quellcode: probalign  ]

multiple sequence alignment using partition function posterior probabilities

Probalign uses partition function posterior probability estimates to compute maximum expected accuracy multiple sequence alignments. It performs statistically significantly better than the leading alignment programs Probcons v1.1, MAFFT v5.851, and MUSCLE v3.6 on BAliBASE 3.0, HOMSTRAD, and OXBENCH benchmarks. Probalign improvements are largest on datasets containing N/C terminal extensions and on datasets with long and heterogeneous length sequences. On heteregeneous length datasets containing repeats Probalign alignment accuracy is 10% and 15% higher than the other three methods when standard deviation of length is at least 300 and 400.

Andere Pakete mit Bezug zu probalign

• dep: libc6 (>= 2.34) [nicht alpha, arm64, ia64, loong64, sh4]

  GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
  auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.36) [loong64, sh4]

  dep: libc6 (>= 2.38) [arm64]

• dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

  GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
  auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.36) [ia64]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [nicht armel, armhf, hppa, ia64, m68k, ppc64, ppc64el, sh4]

  GCC Support-Bibliothek

  dep: libgcc-s1 (>= 3.3.4) [sh4]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4.4) [ppc64, ppc64el]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  GCC Support-Bibliothek

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  GCC Support-Bibliothek

• dep: libstdc++6 (>= 11) [nicht arm64, riscv64]

  GNU-Implementierung der Standard-C++-Bibliothek (Version 3)

  dep: libstdc++6 (>= 13.1) [arm64, riscv64]

• dep: libunwind8 [ia64]

  Bibliothek zur Ermittlung der Aufrufkette eines Programms - Laufzeit

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Download für alle verfügbaren Architekturen

Architektur	Version	Paketgröße	Größe (installiert)	Dateien
alpha (inoffizielle Portierung)	1.4-10	69,0 kB	220,0 kB	[Liste der Dateien]
amd64	1.4-10	68,9 kB	175,0 kB	[Liste der Dateien]
arm64	1.4-10+b1	66,9 kB	220,0 kB	[Liste der Dateien]
armel	1.4-10	55,1 kB	142,0 kB	[Liste der Dateien]
armhf	1.4-10	53,9 kB	114,0 kB	[Liste der Dateien]
hppa (inoffizielle Portierung)	1.4-10	66,9 kB	156,0 kB	[Liste der Dateien]
i386	1.4-10	61,4 kB	158,0 kB	[Liste der Dateien]
ia64 (inoffizielle Portierung)	1.4-10	97,8 kB	292,0 kB	[Liste der Dateien]
loong64 (inoffizielle Portierung)	1.4-10	62,1 kB	156,0 kB	[Liste der Dateien]
m68k (inoffizielle Portierung)	1.4-10	60,2 kB	162,0 kB	[Liste der Dateien]
mips64el	1.4-10	65,4 kB	223,0 kB	[Liste der Dateien]
ppc64 (inoffizielle Portierung)	1.4-10	70,0 kB	219,0 kB	[Liste der Dateien]
ppc64el	1.4-10	78,4 kB	219,0 kB	[Liste der Dateien]
riscv64	1.4-10+b1	67,4 kB	132,0 kB	[Liste der Dateien]
s390x	1.4-10	56,7 kB	171,0 kB	[Liste der Dateien]
sh4 (inoffizielle Portierung)	1.4-10	72,5 kB	155,0 kB	[Liste der Dateien]
sparc64 (inoffizielle Portierung)	1.4-10	60,5 kB	1.054,0 kB	[Liste der Dateien]
x32 (inoffizielle Portierung)	1.4-10	70,0 kB	170,0 kB	[Liste der Dateien]