パッケージ: probalign (1.4-10 など)
probalign に関するリンク
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メンテナ:
外部の資源:
- ホームページ [web.njit.edu]
類似のパッケージ:
multiple sequence alignment using partition function posterior probabilities
Probalign uses partition function posterior probability estimates to compute maximum expected accuracy multiple sequence alignments. It performs statistically significantly better than the leading alignment programs Probcons v1.1, MAFFT v5.851, and MUSCLE v3.6 on BAliBASE 3.0, HOMSTRAD, and OXBENCH benchmarks. Probalign improvements are largest on datasets containing N/C terminal extensions and on datasets with long and heterogeneous length sequences. On heteregeneous length datasets containing repeats Probalign alignment accuracy is 10% and 15% higher than the other three methods when standard deviation of length is at least 300 and 400.
その他の probalign 関連パッケージ
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- dep: libc6 (>= 2.34) [alpha, ia64, sh4 以外]
- GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb
- dep: libc6 (>= 2.36) [sh4]
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- dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]
- GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6.1-udeb
- dep: libc6.1 (>= 2.36) [ia64]
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- dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [armel, armhf, hppa, ia64, m68k, ppc64, ppc64el, sh4 以外]
- GCC 共有ライブラリ
- dep: libgcc-s1 (>= 3.3.4) [sh4]
- dep: libgcc-s1 (>= 3.4.4) [ppc64, ppc64el]
- dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]
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- dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]
- GCC 共有ライブラリ
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- dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]
- GCC 共有ライブラリ
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- dep: libstdc++6 (>= 11) [riscv64 以外]
- GNU 標準 C++ ライブラリ v3
- dep: libstdc++6 (>= 13.1) [riscv64]
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- dep: libunwind8 [ia64]
- プログラムのコールチェーン測定ライブラリ - ランタイム版
probalign のダウンロード
アーキテクチャ | バージョン | パッケージサイズ | インストールサイズ | ファイル |
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alpha (非公式の移植版) | 1.4-10 | 69.0 kB | 220.0 kB | [ファイル一覧] |
amd64 | 1.4-10 | 68.9 kB | 175.0 kB | [ファイル一覧] |
arm64 | 1.4-10 | 64.6 kB | 219.0 kB | [ファイル一覧] |
armel | 1.4-10 | 55.1 kB | 142.0 kB | [ファイル一覧] |
armhf | 1.4-10 | 53.9 kB | 114.0 kB | [ファイル一覧] |
hppa (非公式の移植版) | 1.4-10 | 66.9 kB | 156.0 kB | [ファイル一覧] |
i386 | 1.4-10 | 61.4 kB | 158.0 kB | [ファイル一覧] |
ia64 (非公式の移植版) | 1.4-10 | 97.8 kB | 292.0 kB | [ファイル一覧] |
m68k (非公式の移植版) | 1.4-10 | 60.2 kB | 162.0 kB | [ファイル一覧] |
mips64el | 1.4-10 | 65.4 kB | 223.0 kB | [ファイル一覧] |
ppc64 (非公式の移植版) | 1.4-10 | 70.0 kB | 219.0 kB | [ファイル一覧] |
ppc64el | 1.4-10 | 78.4 kB | 219.0 kB | [ファイル一覧] |
riscv64 | 1.4-10+b1 | 67.4 kB | 132.0 kB | [ファイル一覧] |
s390x | 1.4-10 | 56.7 kB | 171.0 kB | [ファイル一覧] |
sh4 (非公式の移植版) | 1.4-10 | 72.5 kB | 155.0 kB | [ファイル一覧] |
sparc64 (非公式の移植版) | 1.4-10 | 60.5 kB | 1,054.0 kB | [ファイル一覧] |
x32 (非公式の移植版) | 1.4-10 | 70.0 kB | 170.0 kB | [ファイル一覧] |