Пакунок: probalign (1.4-10 and others)

[ Source: probalign  ]

multiple sequence alignment using partition function posterior probabilities

Probalign uses partition function posterior probability estimates to compute maximum expected accuracy multiple sequence alignments. It performs statistically significantly better than the leading alignment programs Probcons v1.1, MAFFT v5.851, and MUSCLE v3.6 on BAliBASE 3.0, HOMSTRAD, and OXBENCH benchmarks. Probalign improvements are largest on datasets containing N/C terminal extensions and on datasets with long and heterogeneous length sequences. On heteregeneous length datasets containing repeats Probalign alignment accuracy is 10% and 15% higher than the other three methods when standard deviation of length is at least 300 and 400.

Інші пакунки пов'язані з probalign

• dep: libc6 (>= 2.34) [not arm64]

  Бібліотека GNU C: спільні бібліотеки
  also a virtual package provided by libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.38) [arm64]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [not armel, armhf, ppc64el]

  Допоміжна бібліотека GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4.4) [ppc64el]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

• dep: libstdc++6 (>= 11) [not arm64, riscv64]

  Стандартна бібліотека C++ GNU, версії 3

  dep: libstdc++6 (>= 13.1) [arm64, riscv64]

Завантажити probalign

Завантаження для всіх доступних архітектур

Архітектура	Версія	Розмір пакунка	Розмір після встановлення	Файли
amd64	1.4-10	68.9 kB	175.0 kB	[список файлів]
arm64	1.4-10+b1	66.9 kB	220.0 kB	[список файлів]
armel	1.4-10	55.1 kB	142.0 kB	[список файлів]
armhf	1.4-10	53.9 kB	114.0 kB	[список файлів]
i386	1.4-10	61.4 kB	158.0 kB	[список файлів]
mips64el	1.4-10	65.4 kB	223.0 kB	[список файлів]
ppc64el	1.4-10	78.4 kB	219.0 kB	[список файлів]
riscv64	1.4-10+b1	67.4 kB	132.0 kB	[список файлів]
s390x	1.4-10	56.7 kB	171.0 kB	[список файлів]