Paket: probalign (1.4-10 ve diğerleri)

[ Kaynak: probalign  ]

multiple sequence alignment using partition function posterior probabilities

Probalign uses partition function posterior probability estimates to compute maximum expected accuracy multiple sequence alignments. It performs statistically significantly better than the leading alignment programs Probcons v1.1, MAFFT v5.851, and MUSCLE v3.6 on BAliBASE 3.0, HOMSTRAD, and OXBENCH benchmarks. Probalign improvements are largest on datasets containing N/C terminal extensions and on datasets with long and heterogeneous length sequences. On heteregeneous length datasets containing repeats Probalign alignment accuracy is 10% and 15% higher than the other three methods when standard deviation of length is at least 300 and 400.

probalign ile İlgili Diğer Paketler

• dep: libc6 (>= 2.34) [alpha, arm64, ia64, sh4 değil]

  GNU C Library: Shared libraries
  ayrıca şunun tarafından sağlanan bir sanal paket libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.36) [sh4]

  dep: libc6 (>= 2.38) [arm64]

• dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

  GNU C Library: Shared libraries
  ayrıca şunun tarafından sağlanan bir sanal paket libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.36) [ia64]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [armel, armhf, hppa, ia64, m68k, ppc64, ppc64el, sh4 değil]

  GCC support library

  dep: libgcc-s1 (>= 3.3.4) [sh4]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4.4) [ppc64, ppc64el]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  GCC support library

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  GCC support library

• dep: libstdc++6 (>= 11) [arm64, riscv64 değil]

  GNU Standard C++ Library v3

  dep: libstdc++6 (>= 13.1) [arm64, riscv64]

• dep: libunwind8 [ia64]

  library to determine the call-chain of a program - runtime

probalign indir

Tüm mevcut mimariler için indir

Mimari	Sürüm	Paket Boyutu	Kurulu Boyut	Dosyalar
alpha (resmi olmayan port)	1.4-10	69,0 kB	220,0 kB	[dosya listesi]
amd64	1.4-10	68,9 kB	175,0 kB	[dosya listesi]
arm64	1.4-10+b1	66,9 kB	220,0 kB	[dosya listesi]
armel	1.4-10	55,1 kB	142,0 kB	[dosya listesi]
armhf	1.4-10	53,9 kB	114,0 kB	[dosya listesi]
hppa (resmi olmayan port)	1.4-10	66,9 kB	156,0 kB	[dosya listesi]
i386	1.4-10	61,4 kB	158,0 kB	[dosya listesi]
ia64 (resmi olmayan port)	1.4-10	97,8 kB	292,0 kB	[dosya listesi]
m68k (resmi olmayan port)	1.4-10	60,2 kB	162,0 kB	[dosya listesi]
mips64el	1.4-10	65,4 kB	223,0 kB	[dosya listesi]
ppc64 (resmi olmayan port)	1.4-10	70,0 kB	219,0 kB	[dosya listesi]
ppc64el	1.4-10	78,4 kB	219,0 kB	[dosya listesi]
riscv64	1.4-10+b1	67,4 kB	132,0 kB	[dosya listesi]
s390x	1.4-10	56,7 kB	171,0 kB	[dosya listesi]
sh4 (resmi olmayan port)	1.4-10	72,5 kB	155,0 kB	[dosya listesi]
sparc64 (resmi olmayan port)	1.4-10	60,5 kB	1.054,0 kB	[dosya listesi]
x32 (resmi olmayan port)	1.4-10	70,0 kB	170,0 kB	[dosya listesi]