Paquet : probalign (1.4-10 et autres)
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Paquets similaires :
alignement de séquences multiples en utilisant les probabilités à postériori de la fonction de partition
Probalign utilise l’estimation de probabilités à postériori de la fonction de partition pour calculer les alignements de séquence multiple avec la précision maximale attendue. Il obtient des résultats statistiquement significativement meilleurs que les programmes d´alignement leaders Probcons v1.1, MAFFT v5.851 et MUSCLE v3.6 avec les tests de performance BAliBASE 3.0, HOMSTRAD et OXBENCH. Les améliorations de Probalign sont plus importantes sur les ensembles de données contenant des extrémités N/C-terminales et sur les ensembles de données avec des séquences de longueurs hétérogènes. Sur les ensembles de données de longueurs hétérogènes contenant des répétitions, la précision d’alignement de Probalign est 10 % et 15 % meilleure que les trois autres méthodes quand l´écart-type de longueur est au moins 300 et 400.
Autres paquets associés à probalign
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- dep: libc6 (>= 2.34) [non alpha, ia64, sh4]
- bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb
- dep: libc6 (>= 2.36) [sh4]
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- dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]
- bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
un paquet virtuel est également fourni par libc6.1-udeb
- dep: libc6.1 (>= 2.36) [ia64]
-
- dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [non armel, armhf, hppa, ia64, m68k, ppc64, ppc64el, sh4]
- bibliothèque de prise en charge de GCC
- dep: libgcc-s1 (>= 3.3.4) [sh4]
- dep: libgcc-s1 (>= 3.4.4) [ppc64, ppc64el]
- dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]
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- dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]
- bibliothèque de prise en charge de GCC
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- dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]
- bibliothèque de prise en charge de GCC
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- dep: libstdc++6 (>= 11) [non riscv64]
- bibliothèque standard C++ de GNU v3
- dep: libstdc++6 (>= 13.1) [riscv64]
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- dep: libunwind8 [ia64]
- bibliothèque pour déterminer la chaîne d'appel d'un programme –⋅exécutable
Télécharger probalign
Architecture | Version | Taille du paquet | Espace occupé une fois installé | Fichiers |
---|---|---|---|---|
alpha (portage non officiel) | 1.4-10 | 69,0 ko | 220,0 ko | [liste des fichiers] |
amd64 | 1.4-10 | 68,9 ko | 175,0 ko | [liste des fichiers] |
arm64 | 1.4-10 | 64,6 ko | 219,0 ko | [liste des fichiers] |
armel | 1.4-10 | 55,1 ko | 142,0 ko | [liste des fichiers] |
armhf | 1.4-10 | 53,9 ko | 114,0 ko | [liste des fichiers] |
hppa (portage non officiel) | 1.4-10 | 66,9 ko | 156,0 ko | [liste des fichiers] |
i386 | 1.4-10 | 61,4 ko | 158,0 ko | [liste des fichiers] |
ia64 (portage non officiel) | 1.4-10 | 97,8 ko | 292,0 ko | [liste des fichiers] |
m68k (portage non officiel) | 1.4-10 | 60,2 ko | 162,0 ko | [liste des fichiers] |
mips64el | 1.4-10 | 65,4 ko | 223,0 ko | [liste des fichiers] |
ppc64 (portage non officiel) | 1.4-10 | 70,0 ko | 219,0 ko | [liste des fichiers] |
ppc64el | 1.4-10 | 78,4 ko | 219,0 ko | [liste des fichiers] |
riscv64 | 1.4-10+b1 | 67,4 ko | 132,0 ko | [liste des fichiers] |
s390x | 1.4-10 | 56,7 ko | 171,0 ko | [liste des fichiers] |
sh4 (portage non officiel) | 1.4-10 | 72,5 ko | 155,0 ko | [liste des fichiers] |
sparc64 (portage non officiel) | 1.4-10 | 60,5 ko | 1 054,0 ko | [liste des fichiers] |
x32 (portage non officiel) | 1.4-10 | 70,0 ko | 170,0 ko | [liste des fichiers] |