Pakiet: probalign (1.4-10 i inne)

[ Pakiet źródłowy: probalign  ]

multiple sequence alignment using partition function posterior probabilities

Probalign uses partition function posterior probability estimates to compute maximum expected accuracy multiple sequence alignments. It performs statistically significantly better than the leading alignment programs Probcons v1.1, MAFFT v5.851, and MUSCLE v3.6 on BAliBASE 3.0, HOMSTRAD, and OXBENCH benchmarks. Probalign improvements are largest on datasets containing N/C terminal extensions and on datasets with long and heterogeneous length sequences. On heteregeneous length datasets containing repeats Probalign alignment accuracy is 10% and 15% higher than the other three methods when standard deviation of length is at least 300 and 400.

Inne pakiety związane z probalign

• dep: libc6 (>= 2.34) [nie alpha, arm64, ia64, sh4]

  Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
  również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.36) [sh4]

  dep: libc6 (>= 2.38) [arm64]

• dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

  Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
  również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.36) [ia64]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [nie armel, armhf, hppa, ia64, m68k, ppc64, ppc64el, sh4]

  Biblioteka wspomagająca GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.3.4) [sh4]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4.4) [ppc64, ppc64el]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  Biblioteka wspomagająca GCC

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  Biblioteka wspomagająca GCC

• dep: libstdc++6 (>= 11) [nie arm64, riscv64]

  Standardowa biblioteka GNU C++, wersja 3

  dep: libstdc++6 (>= 13.1) [arm64, riscv64]

• dep: libunwind8 [ia64]

  Biblioteka do ustalania łańcucha wywołań programu - środowisko uruchomieniowe

Pobieranie probalign

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur

Architektura	Wersja	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
alpha (port nieoficjalny)	1.4-10	69,0 KiB	220,0 KiB	[lista plików]
amd64	1.4-10	68,9 KiB	175,0 KiB	[lista plików]
arm64	1.4-10+b1	66,9 KiB	220,0 KiB	[lista plików]
armel	1.4-10	55,1 KiB	142,0 KiB	[lista plików]
armhf	1.4-10	53,9 KiB	114,0 KiB	[lista plików]
hppa (port nieoficjalny)	1.4-10	66,9 KiB	156,0 KiB	[lista plików]
i386	1.4-10	61,4 KiB	158,0 KiB	[lista plików]
ia64 (port nieoficjalny)	1.4-10	97,8 KiB	292,0 KiB	[lista plików]
m68k (port nieoficjalny)	1.4-10	60,2 KiB	162,0 KiB	[lista plików]
mips64el	1.4-10	65,4 KiB	223,0 KiB	[lista plików]
ppc64 (port nieoficjalny)	1.4-10	70,0 KiB	219,0 KiB	[lista plików]
ppc64el	1.4-10	78,4 KiB	219,0 KiB	[lista plików]
riscv64	1.4-10+b1	67,4 KiB	132,0 KiB	[lista plików]
s390x	1.4-10	56,7 KiB	171,0 KiB	[lista plików]
sh4 (port nieoficjalny)	1.4-10	72,5 KiB	155,0 KiB	[lista plików]
sparc64 (port nieoficjalny)	1.4-10	60,5 KiB	1 054,0 KiB	[lista plików]
x32 (port nieoficjalny)	1.4-10	70,0 KiB	170,0 KiB	[lista plików]