Paket: lagan (2.0-10 och andra)

[ Källkod: lagan  ]

highly parametrizable pairwise global genome sequence aligner

Lagan takes local alignments generated by CHAOS as anchors, and limits the search area of the Needleman-Wunsch algorithm around these anchors.

Multi-LAGAN is a generalization of the pairwise algorithm to multiple sequence alignment. M-LAGAN performs progressive pairwise alignments, guided by a user-specified phylogenetic tree. Alignments are aligned to other alignments using the sum-of-pairs metric.

Andra paket besläktade med lagan

• dep: libc6 (>= 2.34) [ej alpha, arm64, ia64, loong64, sh4]

  GNU C-bibliotek: Delade bibliotek
  också ett virtuellt paket som tillhandahålls av libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.37) [loong64, sh4]

  dep: libc6 (>= 2.38) [arm64]

• dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

  GNU C-bibliotek: Delade bibliotek
  också ett virtuellt paket som tillhandahålls av libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, arm64, i386, loong64, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, x32]

  GCC stödbibliotek

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, riscv64, sh4, sparc64]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  GCC stödbibliotek

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  GCC stödbibliotek

• dep: libstdc++6 (>= 13.1)

  GNU standardbibliotek v3 för C++

• dep: libunwind8 [ia64]

  library to determine the call-chain of a program - runtime

Hämta lagan

Hämtningar för alla tillgängliga arkitekturer

Arkitektur	Version	Paketstorlek	Installerad storlek	Filer
alpha (inofficiell anpassning)	2.0-10	178,8 kbyte	1.898,0 kbyte	[filförteckning]
amd64	2.0-10	179,9 kbyte	834,0 kbyte	[filförteckning]
arm64	2.0-10+b2	173,8 kbyte	1.771,0 kbyte	[filförteckning]
armel	2.0-10	163,2 kbyte	691,0 kbyte	[filförteckning]
armhf	2.0-10	162,4 kbyte	583,0 kbyte	[filförteckning]
hppa (inofficiell anpassning)	2.0-10	174,6 kbyte	716,0 kbyte	[filförteckning]
i386	2.0-10	186,7 kbyte	831,0 kbyte	[filförteckning]
ia64 (inofficiell anpassning)	2.0-10	213,5 kbyte	1.035,0 kbyte	[filförteckning]
loong64 (inofficiell anpassning)	2.0-10	173,5 kbyte	890,0 kbyte	[filförteckning]
m68k (inofficiell anpassning)	2.0-10	155,6 kbyte	683,0 kbyte	[filförteckning]
mips64el	2.0-10	182,3 kbyte	1.924,0 kbyte	[filförteckning]
ppc64 (inofficiell anpassning)	2.0-10	190,5 kbyte	2.034,0 kbyte	[filförteckning]
ppc64el	2.0-10	199,0 kbyte	1.898,0 kbyte	[filförteckning]
riscv64	2.0-10	180,8 kbyte	682,0 kbyte	[filförteckning]
s390x	2.0-10	186,6 kbyte	802,0 kbyte	[filförteckning]
sh4 (inofficiell anpassning)	2.0-10	179,3 kbyte	1.747,0 kbyte	[filförteckning]
sparc64 (inofficiell anpassning)	2.0-10	166,3 kbyte	23.868,0 kbyte	[filförteckning]
x32 (inofficiell anpassning)	2.0-10	174,9 kbyte	796,0 kbyte	[filförteckning]